RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-208ENST00000464518 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.37■■■□□ 2.77
SLC13A3-208ENST00000464518 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
SLC13A3-208ENST00000464518 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.64■■■□□ 2.34
SLC13A3-208ENST00000464518 ABCC9O60706 1549 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC13A3-208ENST00000464518 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.33■■■□□ 2.29
SLC13A3-208ENST00000464518 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC13A3-208ENST00000464518 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC13A3-208ENST00000464518 NACADO15069 1562 aa27.81■■■□□ 2.04
SLC13A3-208ENST00000464518 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC13A3-208ENST00000464518 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.35■■□□□ 1.97
SLC13A3-208ENST00000464518 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
SLC13A3-208ENST00000464518 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.25■■□□□ 1.95
SLC13A3-208ENST00000464518 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.2■■□□□ 1.94
SLC13A3-208ENST00000464518 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.02■■□□□ 1.92
SLC13A3-208ENST00000464518 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.85■■□□□ 1.89
SLC13A3-208ENST00000464518 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC13A3-208ENST00000464518 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC13A3-208ENST00000464518 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC13A3-208ENST00000464518 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC13A3-208ENST00000464518 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SLC13A3-208ENST00000464518 SCRIBQ14160 1630 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC13A3-208ENST00000464518 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SLC13A3-208ENST00000464518 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC13A3-208ENST00000464518 CUX2O14529 1486 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC13A3-208ENST00000464518 NCAPD3P42695 1498 aa25.65■■□□□ 1.7
SLC13A3-208ENST00000464518 ERCC6Q03468 1493 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC13A3-208ENST00000464518 HMGXB3Q12766 1538 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC13A3-208ENST00000464518 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.46■■□□□ 1.67
SLC13A3-208ENST00000464518 SMARCA2P51531 1590 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC13A3-208ENST00000464518 SMARCA4P51532 1647 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC13A3-208ENST00000464518 NESP48681 1621 aa25.21■■□□□ 1.63
SLC13A3-208ENST00000464518 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SLC13A3-208ENST00000464518 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC13A3-208ENST00000464518 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SLC13A3-208ENST00000464518 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SLC13A3-208ENST00000464518 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.16■■□□□ 1.62
SLC13A3-208ENST00000464518 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25■■□□□ 1.59
SLC13A3-208ENST00000464518 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.94■■□□□ 1.58
SLC13A3-208ENST00000464518 FOXD1Q16676 465 aa24.88■■□□□ 1.57
SLC13A3-208ENST00000464518 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.87■■□□□ 1.57
SLC13A3-208ENST00000464518 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.8■■□□□ 1.56
SLC13A3-208ENST00000464518 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.77■■□□□ 1.56
SLC13A3-208ENST00000464518 WDR62O43379 1518 aa24.76■■□□□ 1.55
SLC13A3-208ENST00000464518 TRIM41Q8WV44 630 aa24.65■■□□□ 1.54
SLC13A3-208ENST00000464518 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC13A3-208ENST00000464518 WIZO95785 1651 aa24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3-208ENST00000464518 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3-208ENST00000464518 CFTRP13569 1480 aa24.47■■□□□ 1.51
SLC13A3-208ENST00000464518 OSCARQ8IYS5 282 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3-208ENST00000464518 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3-208ENST00000464518 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SLC13A3-208ENST00000464518 PRDM2Q13029 1718 aa24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3-208ENST00000464518 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SLC13A3-208ENST00000464518 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3-208ENST00000464518 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3-208ENST00000464518 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC13A3-208ENST00000464518 IFT140Q96RY7 1462 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC13A3-208ENST00000464518 ARHGEF11O15085 1522 aa24.05■■□□□ 1.44
SLC13A3-208ENST00000464518 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SLC13A3-208ENST00000464518 ABCC8Q09428 1581 aa24.03■■□□□ 1.44
SLC13A3-208ENST00000464518 TOPBP1Q92547 1522 aa24■■□□□ 1.43
SLC13A3-208ENST00000464518 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
SLC13A3-208ENST00000464518 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.94■■□□□ 1.42
SLC13A3-208ENST00000464518 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3-208ENST00000464518 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SLC13A3-208ENST00000464518 CHD1O14646 1710 aa23.81■■□□□ 1.4
SLC13A3-208ENST00000464518 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC13A3-208ENST00000464518 ARAP1Q96P48 1450 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC13A3-208ENST00000464518 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
SLC13A3-208ENST00000464518 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SLC13A3-208ENST00000464518 WDR97A6NE52 1622 aa23.73■■□□□ 1.39
SLC13A3-208ENST00000464518 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.69■■□□□ 1.38
SLC13A3-208ENST00000464518 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SLC13A3-208ENST00000464518 FBLN2P98095 1184 aa23.61■■□□□ 1.37
SLC13A3-208ENST00000464518 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC13A3-208ENST00000464518 SOGA1O94964 1423 aa23.59■■□□□ 1.37
SLC13A3-208ENST00000464518 SYNJ1O43426 1573 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC13A3-208ENST00000464518 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SLC13A3-208ENST00000464518 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.56■■□□□ 1.36
SLC13A3-208ENST00000464518 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.56■■□□□ 1.36
SLC13A3-208ENST00000464518 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SLC13A3-208ENST00000464518 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC13A3-208ENST00000464518 GRIN2BQ13224 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
SLC13A3-208ENST00000464518 SYNJ2O15056 1496 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC13A3-208ENST00000464518 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SLC13A3-208ENST00000464518 CUX1P39880 1505 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3-208ENST00000464518 PBRM1Q86U86 1689 aa23.35■■□□□ 1.33
SLC13A3-208ENST00000464518 MSH5O43196 834 aa23.34■■□□□ 1.33
SLC13A3-208ENST00000464518 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3-208ENST00000464518 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.28■■□□□ 1.32
SLC13A3-208ENST00000464518 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.27■■□□□ 1.32
SLC13A3-208ENST00000464518 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SLC13A3-208ENST00000464518 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.22■■□□□ 1.31
SLC13A3-208ENST00000464518 GRIN2AQ12879 1464 aa23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3-208ENST00000464518 ADRA2BP18089 450 aa23.16■■□□□ 1.3
SLC13A3-208ENST00000464518 NUP160Q12769 1436 aa23.14■■□□□ 1.29
SLC13A3-208ENST00000464518 ADAMTS12P58397 1594 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC13A3-208ENST00000464518 CEP170Q5SW79 1584 aa23.1■■□□□ 1.29
SLC13A3-208ENST00000464518 SHROOM2Q13796 1616 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC13A3-208ENST00000464518 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.28
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