RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 MT-ND5P03915 603 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 IL1R1P14778 569 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 STT3AP46977 705 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 AK2P54819 239 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 ZXDAP98168 799 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 MGAT5BQ3V5L5 792 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 ZNF627Q7L945 461 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 CHST8Q9H2A9 424 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 FNIP2Q9P278 1114 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 MID2Q9UJV3 735 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 H7C4K7 107 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 NCK2O43639 380 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 PDHA1P08559 390 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 SRGNP10124 158 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 TSHRP16473 764 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 TNFSF4P23510 183 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 LRPAP1P30533 357 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 TM4SF4P48230 202 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 CARSP49589 748 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 MYO1EQ12965 1108 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 VWA1Q6PCB0 445 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 SRLQ86TD4 932 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 LNX2Q8N448 690 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 CAVIN3Q969G5 261 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 FAM136AQ96C01 138 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 CCDC138Q96M89 665 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 MYD88Q99836 296 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 DMTF1Q9Y222 760 aa5.16□□□□□ -1.58
RBM39-211ENST00000426951 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 RAB27BO00194 218 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 PPM1DO15297 605 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 YY2O15391 372 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 RHOP08100 348 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 HKR1P10072 659 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 DGKEP52429 567 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 ITGA8P53708 1063 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 PRKAG1P54619 331 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 SP2Q02086 613 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 E2F2Q14209 437 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 BRD3Q15059 726 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 ICE2Q659A1 982 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 Q6YL49 198 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 RNF44Q7L0R7 432 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 YAF2Q8IY57 180 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 FAM109AQ8N4B1 249 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 RNF152Q8N8N0 203 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 PPP2R3CQ969Q6 453 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 IQCDQ96DY2 449 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 FBXL20Q96IG2 436 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 NELL2Q99435 816 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 SERHLQ9NQF3 203 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 COL4A3Q01955 1670 aa5.15□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 RASA4BC9J798 803 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 RASA4O43374 803 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 PEX1O43933 1283 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 FSHBP01225 129 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 CHRM2P08172 466 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 KCNA3P22001 575 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 ITIH3Q06033 890 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 SLC29A2Q14542 456 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 INSCQ1MX18 579 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 FAM209BQ5JX69 171 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM39-211ENST00000426951 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms