RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 KRT4P19013 534 aa26.63■■□□□ 1.85
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HOXB3-201ENST00000311626 HSDL1Q3SXM5 330 aa26.63■■□□□ 1.85
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HOXB3-201ENST00000311626 RSAD2Q8WXG1 361 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXB3-201ENST00000311626 CXorf56Q9H5V9 222 aa26.61■■□□□ 1.85
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HOXB3-201ENST00000311626 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 SHOC2Q9UQ13 582 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 TDRPQ86YL5 185 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-201ENST00000311626 IGDCC3Q8IVU1 814 aa26.59■■□□□ 1.85
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