RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 AGAP3Q96P47 875 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 M0QYV0 167 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 LINGO3P0C6S8 592 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TKFCQ3LXA3 575 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ICA1LQ8NDH6 482 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 EXD1Q8NHP7 514 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 FBXO40Q9UH90 709 aa15.12■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GOLGA8OA6NCC3 632 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GOLGA8NF8WBI6 632 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KCNA4P22459 653 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 AMPD1P23109 780 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CHRNA5P30532 468 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 DSG3P32926 999 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 NPNTQ6UXI9 565 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 INPP5DQ92835 1189 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ACSS2Q9NR19 701 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CYB561D2O14569 222 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GSC2O15499 205 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ASMTLO95671 621 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RAP1GAPP47736 663 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MAMLD1Q13495 774 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 DAW1Q8N136 415 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 FERMT1Q9BQL6 677 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GPR88Q9GZN0 384 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 APPL1Q9UKG1 709 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KIF1AQ12756 1690 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TBX10O75333 385 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RINLQ6ZS11 566 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SESTD1Q86VW0 696 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PAF1Q8N7H5 531 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CEP120Q8N960 986 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 WDR60Q8WVS4 1066 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CNBD2Q96M20 576 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CEP41Q9BYV8 373 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PSTPIP1O43586 416 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 LIASO43766 372 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PEX6Q13608 980 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MORF4L2Q15014 288 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 IRGCQ6NXR0 463 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SEC14L1Q92503 715 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RIT2Q99578 217 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TYK2P29597 1187 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ABCG1P45844 678 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CNGA3Q16281 694 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PODNQ7Z5L7 613 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SP8Q8IXZ3 490 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KLC2Q9H0B6 622 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RNF146Q9NTX7 359 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 AK5Q9Y6K8 562 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MYH3P11055 1940 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KRT7P08729 469 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SPP2Q13103 211 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 LPCAT4Q643R3 524 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 HACE1Q8IYU2 909 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 CDKL2Q92772 493 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 GCNAQ96QF7 691 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM109Q9BVC6 243 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KCND2Q9NZV8 630 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa15.1■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 E9PBE3 544 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 KLHL41O60662 606 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 PSAPP07602 524 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
PTPRN-201ENST00000295718 MMP14P50281 582 aa15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms