RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sapcd2Q9D818 391 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ParvaQ9EPC1 372 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Siah3B2RWG3 268 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt90E9Q1Z0 538 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd65F6YK91 380 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sept7O55131 436 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdh16O88338 830 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AlplP09242 524 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkceP16054 737 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PdgfaP20033 211 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rasgrf1P27671 1262 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptk2P34152 1090 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Jdp2P97875 163 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpina1eQ00898 413 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RalgdsQ03385 852 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptgs2Q05769 604 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrn4clQ3TYX2 239 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8773Q3UQ24 132 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spag6Q3V0U9 509 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sema5bQ60519 1093 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nuak1Q641K5 658 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chsy1Q6ZQ11 800 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acap2Q6ZQK5 770 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccnt2Q7TQK0 723 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr35Q8BND3 1181 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trip10Q8CJ53 603 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Caap1Q8VDY9 356 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc39a3Q99K24 317 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nsmce3Q9CPR8 279 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9CPS8 106 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CsadQ9DBE0 493 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xpo7Q9EPK7 1087 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hes6Q9JHE6 224 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atrnl1Q6A051 1378 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dicer1Q8R418 1916 aa6.92□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss51A0A286YDY8 319 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clca3bE9PUL3 1044 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DldO08749 509 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcat1P24288 386 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Irf6P97431 467 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Casp7P97864 303 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glt6d1Q2NKH9 311 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam198bQ3UPI1 517 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm29609Q3UU56 907 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ampd1Q3V1D3 745 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itga1Q3V3R4 1179 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pim2Q62070 370 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptk6Q64434 451 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HpseQ6YGZ1 535 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr151Q7TSN6 422 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf3c2Q8BL74 907 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcaf1Q8BNE1 924 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap24Q8C4V1 747 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam151aQ8QZW3 608 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf426Q8R1D1 550 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atad3Q925I1 591 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpa3Q9CQ71 121 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tsc1Q9EP53 1161 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Speer3W4VSP1 261 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cntnap4Q99P47 1310 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r104E9Q2J5 860 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kbtbd2G3X9X1 623 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam71e2L7N480 754 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnase1l3O55070 310 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RarbP22605 482 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nos2P29477 1144 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stmn2P55821 179 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbx3P70324 741 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 KizQ3UXL4 695 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 OcrlQ6NVF0 900 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psd2Q6P1I6 770 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp263Q8CF60 680 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snapc2Q91XA5 359 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrp8Q924X6 996 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cul2Q9D4H8 745 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ropn1Q9ESG2 212 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arih1Q9Z1K5 555 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MycsQ9Z304 431 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r59E9PUT5 865 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpysl4O35098 572 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sptlc1O35704 473 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il3P01586 166 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elk3P41971 409 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dynlt1P51807 113 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stx2Q00262 289 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kmt5aQ2YDW7 349 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 InscQ3HNM7 579 aa6.91□□□□□ -1.3
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smcr8Q3UMB5 935 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.2 ms