Protein–RNA interactions for Protein: P01586

Il3, Interleukin-3, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il3P01586 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Il3P01586 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Il3P01586 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Il3P01586 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Il3P01586 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Il3P01586 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Il3P01586 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Il3P01586 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Il3P01586 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Il3P01586 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Il3P01586 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Il3P01586 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Il3P01586 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Il3P01586 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Il3P01586 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Il3P01586 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Il3P01586 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Il3P01586 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Il3P01586 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Il3P01586 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Il3P01586 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Il3P01586 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Il3P01586 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Il3P01586 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Il3P01586 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Il3P01586 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Il3P01586 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Il3P01586 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Il3P01586 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Il3P01586 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Il3P01586 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Il3P01586 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Il3P01586 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Il3P01586 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Il3P01586 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Il3P01586 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Il3P01586 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Il3P01586 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Il3P01586 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Il3P01586 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Il3P01586 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Il3P01586 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Il3P01586 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Il3P01586 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Il3P01586 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Il3P01586 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Il3P01586 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Il3P01586 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Il3P01586 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Il3P01586 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Il3P01586 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Il3P01586 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Il3P01586 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Il3P01586 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Il3P01586 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Il3P01586 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Il3P01586 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Il3P01586 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Il3P01586 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Il3P01586 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Il3P01586 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Il3P01586 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Il3P01586 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Il3P01586 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Il3P01586 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Il3P01586 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Il3P01586 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Il3P01586 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Il3P01586 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Il3P01586 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Il3P01586 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Il3P01586 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Il3P01586 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Il3P01586 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Il3P01586 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Il3P01586 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Il3P01586 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Il3P01586 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Il3P01586 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Il3P01586 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Il3P01586 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Il3P01586 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Il3P01586 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Il3P01586 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Il3P01586 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Il3P01586 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Il3P01586 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Il3P01586 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Il3P01586 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Il3P01586 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Il3P01586 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Il3P01586 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Il3P01586 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Il3P01586 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Il3P01586 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Il3P01586 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Il3P01586 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Il3P01586 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Il3P01586 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Il3P01586 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms