Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdh16O88338 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdh16O88338 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdh16O88338 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cdh16O88338 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cdh16O88338 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Cdh16O88338 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cdh16O88338 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cdh16O88338 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cdh16O88338 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cdh16O88338 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cdh16O88338 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdh16O88338 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdh16O88338 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdh16O88338 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdh16O88338 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdh16O88338 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdh16O88338 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdh16O88338 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cdh16O88338 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdh16O88338 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdh16O88338 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdh16O88338 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdh16O88338 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdh16O88338 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdh16O88338 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdh16O88338 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdh16O88338 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdh16O88338 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdh16O88338 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdh16O88338 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdh16O88338 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdh16O88338 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdh16O88338 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdh16O88338 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdh16O88338 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cdh16O88338 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cdh16O88338 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdh16O88338 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdh16O88338 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdh16O88338 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdh16O88338 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdh16O88338 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdh16O88338 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdh16O88338 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdh16O88338 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdh16O88338 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdh16O88338 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdh16O88338 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdh16O88338 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdh16O88338 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdh16O88338 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdh16O88338 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdh16O88338 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh16O88338 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdh16O88338 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh16O88338 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh16O88338 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdh16O88338 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh16O88338 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh16O88338 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh16O88338 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdh16O88338 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdh16O88338 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdh16O88338 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh16O88338 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh16O88338 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdh16O88338 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdh16O88338 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdh16O88338 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh16O88338 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdh16O88338 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdh16O88338 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh16O88338 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh16O88338 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh16O88338 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh16O88338 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdh16O88338 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh16O88338 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh16O88338 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdh16O88338 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdh16O88338 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdh16O88338 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdh16O88338 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdh16O88338 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdh16O88338 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdh16O88338 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdh16O88338 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdh16O88338 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdh16O88338 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdh16O88338 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdh16O88338 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdh16O88338 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdh16O88338 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdh16O88338 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdh16O88338 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdh16O88338 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh16O88338 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdh16O88338 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdh16O88338 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms