Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Chsy1Q6ZQ11 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Chsy1Q6ZQ11 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Chsy1Q6ZQ11 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chsy1Q6ZQ11 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Chsy1Q6ZQ11 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chsy1Q6ZQ11 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Chsy1Q6ZQ11 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Chsy1Q6ZQ11 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Chsy1Q6ZQ11 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chsy1Q6ZQ11 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chsy1Q6ZQ11 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Chsy1Q6ZQ11 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Chsy1Q6ZQ11 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Chsy1Q6ZQ11 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Chsy1Q6ZQ11 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Chsy1Q6ZQ11 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Chsy1Q6ZQ11 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Chsy1Q6ZQ11 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Chsy1Q6ZQ11 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Chsy1Q6ZQ11 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Chsy1Q6ZQ11 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Chsy1Q6ZQ11 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Chsy1Q6ZQ11 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Chsy1Q6ZQ11 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Chsy1Q6ZQ11 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Chsy1Q6ZQ11 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Chsy1Q6ZQ11 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Chsy1Q6ZQ11 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Chsy1Q6ZQ11 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chsy1Q6ZQ11 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chsy1Q6ZQ11 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Chsy1Q6ZQ11 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chsy1Q6ZQ11 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chsy1Q6ZQ11 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chsy1Q6ZQ11 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chsy1Q6ZQ11 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chsy1Q6ZQ11 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chsy1Q6ZQ11 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Chsy1Q6ZQ11 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chsy1Q6ZQ11 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chsy1Q6ZQ11 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Chsy1Q6ZQ11 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Chsy1Q6ZQ11 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chsy1Q6ZQ11 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chsy1Q6ZQ11 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chsy1Q6ZQ11 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chsy1Q6ZQ11 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chsy1Q6ZQ11 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chsy1Q6ZQ11 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chsy1Q6ZQ11 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chsy1Q6ZQ11 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chsy1Q6ZQ11 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chsy1Q6ZQ11 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Chsy1Q6ZQ11 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Chsy1Q6ZQ11 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chsy1Q6ZQ11 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chsy1Q6ZQ11 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chsy1Q6ZQ11 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Chsy1Q6ZQ11 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chsy1Q6ZQ11 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chsy1Q6ZQ11 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chsy1Q6ZQ11 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chsy1Q6ZQ11 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chsy1Q6ZQ11 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chsy1Q6ZQ11 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chsy1Q6ZQ11 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chsy1Q6ZQ11 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chsy1Q6ZQ11 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chsy1Q6ZQ11 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chsy1Q6ZQ11 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chsy1Q6ZQ11 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chsy1Q6ZQ11 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Chsy1Q6ZQ11 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Chsy1Q6ZQ11 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Chsy1Q6ZQ11 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chsy1Q6ZQ11 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Chsy1Q6ZQ11 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Chsy1Q6ZQ11 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chsy1Q6ZQ11 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Chsy1Q6ZQ11 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Chsy1Q6ZQ11 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chsy1Q6ZQ11 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Chsy1Q6ZQ11 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chsy1Q6ZQ11 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chsy1Q6ZQ11 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chsy1Q6ZQ11 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chsy1Q6ZQ11 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chsy1Q6ZQ11 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chsy1Q6ZQ11 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chsy1Q6ZQ11 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chsy1Q6ZQ11 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chsy1Q6ZQ11 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chsy1Q6ZQ11 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chsy1Q6ZQ11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chsy1Q6ZQ11 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms