Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Cul2Q9D4H8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cul2Q9D4H8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cul2Q9D4H8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cul2Q9D4H8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cul2Q9D4H8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cul2Q9D4H8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Cul2Q9D4H8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Cul2Q9D4H8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cul2Q9D4H8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cul2Q9D4H8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Cul2Q9D4H8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cul2Q9D4H8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Cul2Q9D4H8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cul2Q9D4H8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cul2Q9D4H8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cul2Q9D4H8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Cul2Q9D4H8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cul2Q9D4H8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cul2Q9D4H8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cul2Q9D4H8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cul2Q9D4H8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cul2Q9D4H8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cul2Q9D4H8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cul2Q9D4H8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cul2Q9D4H8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cul2Q9D4H8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Cul2Q9D4H8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cul2Q9D4H8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cul2Q9D4H8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cul2Q9D4H8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cul2Q9D4H8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cul2Q9D4H8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cul2Q9D4H8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cul2Q9D4H8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cul2Q9D4H8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Cul2Q9D4H8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cul2Q9D4H8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cul2Q9D4H8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cul2Q9D4H8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul2Q9D4H8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cul2Q9D4H8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cul2Q9D4H8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cul2Q9D4H8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cul2Q9D4H8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cul2Q9D4H8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cul2Q9D4H8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Cul2Q9D4H8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cul2Q9D4H8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cul2Q9D4H8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cul2Q9D4H8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cul2Q9D4H8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cul2Q9D4H8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cul2Q9D4H8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cul2Q9D4H8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Cul2Q9D4H8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cul2Q9D4H8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cul2Q9D4H8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cul2Q9D4H8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cul2Q9D4H8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Cul2Q9D4H8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cul2Q9D4H8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cul2Q9D4H8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Cul2Q9D4H8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cul2Q9D4H8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Cul2Q9D4H8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cul2Q9D4H8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cul2Q9D4H8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cul2Q9D4H8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cul2Q9D4H8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Cul2Q9D4H8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cul2Q9D4H8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cul2Q9D4H8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cul2Q9D4H8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cul2Q9D4H8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cul2Q9D4H8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cul2Q9D4H8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cul2Q9D4H8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cul2Q9D4H8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cul2Q9D4H8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cul2Q9D4H8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cul2Q9D4H8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cul2Q9D4H8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cul2Q9D4H8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul2Q9D4H8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cul2Q9D4H8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul2Q9D4H8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cul2Q9D4H8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cul2Q9D4H8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul2Q9D4H8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul2Q9D4H8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul2Q9D4H8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul2Q9D4H8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.7 ms