Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,13■■■■■ 4,17
Tcaf1Q8BNE1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,91■■■■□ 3,66
Tcaf1Q8BNE1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Tcaf1Q8BNE1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Tcaf1Q8BNE1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
Tcaf1Q8BNE1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Tcaf1Q8BNE1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Tcaf1Q8BNE1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
Tcaf1Q8BNE1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,48■■■■□ 3,27
Tcaf1Q8BNE1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Tcaf1Q8BNE1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Tcaf1Q8BNE1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Tcaf1Q8BNE1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,37■■■■□ 3,09
Tcaf1Q8BNE1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Tcaf1Q8BNE1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Tcaf1Q8BNE1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Tcaf1Q8BNE1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Tcaf1Q8BNE1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Tcaf1Q8BNE1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Tcaf1Q8BNE1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Tcaf1Q8BNE1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Tcaf1Q8BNE1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Tcaf1Q8BNE1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Tcaf1Q8BNE1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Tcaf1Q8BNE1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,36■■■□□ 2,93
Tcaf1Q8BNE1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Tcaf1Q8BNE1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Tcaf1Q8BNE1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,23■■■□□ 2,91
Tcaf1Q8BNE1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Tcaf1Q8BNE1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Tcaf1Q8BNE1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Tcaf1Q8BNE1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Tcaf1Q8BNE1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Tcaf1Q8BNE1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Tcaf1Q8BNE1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Tcaf1Q8BNE1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Tcaf1Q8BNE1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Tcaf1Q8BNE1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Tcaf1Q8BNE1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Tcaf1Q8BNE1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,28■■■□□ 2,76
Tcaf1Q8BNE1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Tcaf1Q8BNE1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Tcaf1Q8BNE1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Tcaf1Q8BNE1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Tcaf1Q8BNE1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Tcaf1Q8BNE1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Tcaf1Q8BNE1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Tcaf1Q8BNE1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Tcaf1Q8BNE1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Tcaf1Q8BNE1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Tcaf1Q8BNE1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,79■■■□□ 2,68
Tcaf1Q8BNE1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Tcaf1Q8BNE1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Tcaf1Q8BNE1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Tcaf1Q8BNE1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Tcaf1Q8BNE1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Tcaf1Q8BNE1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Tcaf1Q8BNE1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,59■■■□□ 2,65
Tcaf1Q8BNE1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Tcaf1Q8BNE1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Tcaf1Q8BNE1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,44■■■□□ 2,62
Tcaf1Q8BNE1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Tcaf1Q8BNE1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Tcaf1Q8BNE1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Tcaf1Q8BNE1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Tcaf1Q8BNE1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Tcaf1Q8BNE1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,34■■■□□ 2,61
Tcaf1Q8BNE1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Tcaf1Q8BNE1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Tcaf1Q8BNE1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Tcaf1Q8BNE1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Tcaf1Q8BNE1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Tcaf1Q8BNE1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,14■■■□□ 2,58
Tcaf1Q8BNE1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Tcaf1Q8BNE1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Tcaf1Q8BNE1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Tcaf1Q8BNE1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Tcaf1Q8BNE1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Tcaf1Q8BNE1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Tcaf1Q8BNE1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Tcaf1Q8BNE1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Tcaf1Q8BNE1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Tcaf1Q8BNE1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,84■■■□□ 2,53
Tcaf1Q8BNE1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Tcaf1Q8BNE1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Tcaf1Q8BNE1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Tcaf1Q8BNE1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Tcaf1Q8BNE1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Tcaf1Q8BNE1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Tcaf1Q8BNE1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Tcaf1Q8BNE1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Tcaf1Q8BNE1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Tcaf1Q8BNE1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Tcaf1Q8BNE1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Tcaf1Q8BNE1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Tcaf1Q8BNE1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Tcaf1Q8BNE1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Tcaf1Q8BNE1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Tcaf1Q8BNE1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
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