Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nsmce3Q9CPR8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Nsmce3Q9CPR8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nsmce3Q9CPR8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Nsmce3Q9CPR8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Nsmce3Q9CPR8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nsmce3Q9CPR8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nsmce3Q9CPR8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nsmce3Q9CPR8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Nsmce3Q9CPR8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Nsmce3Q9CPR8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Nsmce3Q9CPR8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nsmce3Q9CPR8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nsmce3Q9CPR8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Nsmce3Q9CPR8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Nsmce3Q9CPR8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nsmce3Q9CPR8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nsmce3Q9CPR8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nsmce3Q9CPR8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nsmce3Q9CPR8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Nsmce3Q9CPR8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nsmce3Q9CPR8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nsmce3Q9CPR8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nsmce3Q9CPR8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nsmce3Q9CPR8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nsmce3Q9CPR8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nsmce3Q9CPR8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nsmce3Q9CPR8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nsmce3Q9CPR8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nsmce3Q9CPR8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nsmce3Q9CPR8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nsmce3Q9CPR8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nsmce3Q9CPR8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nsmce3Q9CPR8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nsmce3Q9CPR8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nsmce3Q9CPR8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nsmce3Q9CPR8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Nsmce3Q9CPR8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nsmce3Q9CPR8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nsmce3Q9CPR8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nsmce3Q9CPR8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nsmce3Q9CPR8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nsmce3Q9CPR8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nsmce3Q9CPR8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nsmce3Q9CPR8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsmce3Q9CPR8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nsmce3Q9CPR8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nsmce3Q9CPR8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nsmce3Q9CPR8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsmce3Q9CPR8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nsmce3Q9CPR8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nsmce3Q9CPR8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nsmce3Q9CPR8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nsmce3Q9CPR8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nsmce3Q9CPR8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nsmce3Q9CPR8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsmce3Q9CPR8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsmce3Q9CPR8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsmce3Q9CPR8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsmce3Q9CPR8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsmce3Q9CPR8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nsmce3Q9CPR8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nsmce3Q9CPR8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nsmce3Q9CPR8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nsmce3Q9CPR8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nsmce3Q9CPR8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nsmce3Q9CPR8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nsmce3Q9CPR8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nsmce3Q9CPR8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nsmce3Q9CPR8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsmce3Q9CPR8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nsmce3Q9CPR8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nsmce3Q9CPR8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nsmce3Q9CPR8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nsmce3Q9CPR8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nsmce3Q9CPR8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nsmce3Q9CPR8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nsmce3Q9CPR8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nsmce3Q9CPR8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nsmce3Q9CPR8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nsmce3Q9CPR8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nsmce3Q9CPR8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nsmce3Q9CPR8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nsmce3Q9CPR8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nsmce3Q9CPR8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nsmce3Q9CPR8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nsmce3Q9CPR8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms