Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Nsmce3Q9CPR8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Nsmce3Q9CPR8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Nsmce3Q9CPR8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Nsmce3Q9CPR8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Nsmce3Q9CPR8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Nsmce3Q9CPR8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Nsmce3Q9CPR8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Nsmce3Q9CPR8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Nsmce3Q9CPR8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Nsmce3Q9CPR8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Nsmce3Q9CPR8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Nsmce3Q9CPR8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Nsmce3Q9CPR8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Nsmce3Q9CPR8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Nsmce3Q9CPR8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Nsmce3Q9CPR8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Nsmce3Q9CPR8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Nsmce3Q9CPR8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Nsmce3Q9CPR8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Nsmce3Q9CPR8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Nsmce3Q9CPR8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Nsmce3Q9CPR8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Nsmce3Q9CPR8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Nsmce3Q9CPR8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Nsmce3Q9CPR8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Nsmce3Q9CPR8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Nsmce3Q9CPR8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Nsmce3Q9CPR8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Nsmce3Q9CPR8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Nsmce3Q9CPR8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Nsmce3Q9CPR8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Nsmce3Q9CPR8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Nsmce3Q9CPR8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Nsmce3Q9CPR8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Nsmce3Q9CPR8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nsmce3Q9CPR8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Nsmce3Q9CPR8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Nsmce3Q9CPR8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Nsmce3Q9CPR8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Nsmce3Q9CPR8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Nsmce3Q9CPR8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Nsmce3Q9CPR8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Nsmce3Q9CPR8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Nsmce3Q9CPR8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Nsmce3Q9CPR8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Nsmce3Q9CPR8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Nsmce3Q9CPR8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Nsmce3Q9CPR8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Nsmce3Q9CPR8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Nsmce3Q9CPR8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Nsmce3Q9CPR8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Nsmce3Q9CPR8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Nsmce3Q9CPR8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Nsmce3Q9CPR8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Nsmce3Q9CPR8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Nsmce3Q9CPR8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Nsmce3Q9CPR8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Nsmce3Q9CPR8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Nsmce3Q9CPR8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Nsmce3Q9CPR8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Nsmce3Q9CPR8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Nsmce3Q9CPR8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Nsmce3Q9CPR8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Nsmce3Q9CPR8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Nsmce3Q9CPR8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Nsmce3Q9CPR8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Nsmce3Q9CPR8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Nsmce3Q9CPR8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Nsmce3Q9CPR8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Nsmce3Q9CPR8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Nsmce3Q9CPR8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Nsmce3Q9CPR8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Nsmce3Q9CPR8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Nsmce3Q9CPR8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Nsmce3Q9CPR8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Nsmce3Q9CPR8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Nsmce3Q9CPR8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Nsmce3Q9CPR8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Nsmce3Q9CPR8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Nsmce3Q9CPR8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Nsmce3Q9CPR8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Nsmce3Q9CPR8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Nsmce3Q9CPR8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Nsmce3Q9CPR8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Nsmce3Q9CPR8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Nsmce3Q9CPR8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Nsmce3Q9CPR8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Nsmce3Q9CPR8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Nsmce3Q9CPR8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Nsmce3Q9CPR8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,3 ms