Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Casp7P97864 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Casp7P97864 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Casp7P97864 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Casp7P97864 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Casp7P97864 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Casp7P97864 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Casp7P97864 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Casp7P97864 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Casp7P97864 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Casp7P97864 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Casp7P97864 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Casp7P97864 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Casp7P97864 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Casp7P97864 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Casp7P97864 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Casp7P97864 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Casp7P97864 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Casp7P97864 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Casp7P97864 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Casp7P97864 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Casp7P97864 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Casp7P97864 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Casp7P97864 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Casp7P97864 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Casp7P97864 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Casp7P97864 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Casp7P97864 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Casp7P97864 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Casp7P97864 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Casp7P97864 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Casp7P97864 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Casp7P97864 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Casp7P97864 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Casp7P97864 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Casp7P97864 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Casp7P97864 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Casp7P97864 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Casp7P97864 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Casp7P97864 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Casp7P97864 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Casp7P97864 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Casp7P97864 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Casp7P97864 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Casp7P97864 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Casp7P97864 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Casp7P97864 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Casp7P97864 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Casp7P97864 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Casp7P97864 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Casp7P97864 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Casp7P97864 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Casp7P97864 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Casp7P97864 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Casp7P97864 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Casp7P97864 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Casp7P97864 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Casp7P97864 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Casp7P97864 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Casp7P97864 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Casp7P97864 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Casp7P97864 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Casp7P97864 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Casp7P97864 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Casp7P97864 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Casp7P97864 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Casp7P97864 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Casp7P97864 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Casp7P97864 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Casp7P97864 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Casp7P97864 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Casp7P97864 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Casp7P97864 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Casp7P97864 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Casp7P97864 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Casp7P97864 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Casp7P97864 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Casp7P97864 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Casp7P97864 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Casp7P97864 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Casp7P97864 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Casp7P97864 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Casp7P97864 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Casp7P97864 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Casp7P97864 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Casp7P97864 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Casp7P97864 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Casp7P97864 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Casp7P97864 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Casp7P97864 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Casp7P97864 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Casp7P97864 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Casp7P97864 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Casp7P97864 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Casp7P97864 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Casp7P97864 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Casp7P97864 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Casp7P97864 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Casp7P97864 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Casp7P97864 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms