RNA–Protein interactions for RNA: YMR308C

PSE1, Transcript of Karyopherin/importin that interacts with the nuclear pore complex, yeast

Gene PSE1, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSE1	YMR308C	DNF3	Q12674	1656 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	YER181C	P40097	107 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	YIL165C	P40446	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	BNS1	P50084	137 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	ASM4	Q05166	528 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	PAU3	P25610	124 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	SDH3	P33421	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	ADD37	Q03233	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	TIM18	Q08749	192 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	TIM9	O74700	87 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	MSB2	P32334	1306 aa		4.15	□□□□□ -1.74
PSE1	YMR308C	CNE1	P27825	502 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YGR164W	P53291	111 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	KRE1	P17260	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	IRC22	P40006	225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YNL234W	P53857	426 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	SUT2	Q12286	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	CCH1	P50077	2039 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YPS5	P53057	165 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	NUP192	P47054	1683 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	Q0255	P03881	472 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	CTP1	P38152	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	PHS1	P40857	217 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	GPI18	P38211	433 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	SDS23	P53172	527 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	VMR1	P38735	1592 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YBR292C	P38357	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	PEX17	P40155	199 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YNL195C	P40168	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	APS1	P35181	156 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	UBC13	P52490	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YNL046W	P53956	172 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	MOT1	P32333	1867 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	UBC4	P15731	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	SFT2	P38166	215 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	GGC1	P38988	300 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YJL028W	P47062	111 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YNR064C	P53750	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	CUZ1	P53899	274 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	TSC3	Q3E790	80 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	HEM2	P05373	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	LDB16	P25587	256 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	CTF8	P38877	133 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	PAU5	P43575	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	NDD1	Q08887	554 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	BUD3	P25558	1636 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	PAU16	P35994	123 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YDR042C	Q03205	200 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	TVP15	Q03860	143 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	SPG4	Q04438	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	ECM29	P38737	1868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	AHT1	P29589	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	HSP10	P38910	106 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	JJJ3	P47138	172 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	ATO3	Q12359	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	LAA1	P39526	2014 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YGR050C	P53231	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	IRC25	Q07951	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	SVP26	P38869	228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	ATG41	Q12048	136 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	MIC27	P50945	234 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSE1	YMR308C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76

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