RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	COX9	P07255	59 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	HSP150	P32478	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	GEP4	P38812	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YHR140W	P38842	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YER188W	P40103	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	LYS5	P50113	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	NSG1	P38837	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	UPS1	Q05776	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	GAT3	Q07928	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	MCT1	Q12283	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	IRA2	P19158	3079 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	ATP5	P09457	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YIL086C	P40503	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	TTI2	P47168	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	COQ2	P32378	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	FIP1	P45976	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	PRY1	P47032	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	AAH1	P53909	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YOS1	Q3E834	85 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	APS1	P35181	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	SDH4	P37298	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YHR180W	P38868	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	SPG4	Q04438	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	AGA2	P32781	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
GPT2	YKR067W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	PRM5	P40476	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	RNH201	P53942	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	SRP21	P32342	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	GPX1	P36014	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	UTH1	P36135	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	SIM1	P40472	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	CUZ1	P53899	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	ODC2	Q99297	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	INO4	P13902	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	OM14	P38325	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YAR029W	P39549	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	PEX17	P40155	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YIL012W	P40551	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	MRS3	P10566	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	CUP9	P41817	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	YFR045W	P43617	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GPT2	YKR067W	CLB6	P32943	380 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SCW10	Q04951	389 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	ATG5	Q12380	294 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	GPI2	P46961	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	CSI2	Q08054	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	EAF3	Q12432	401 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	STE4	P18851	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MRP17	P28778	131 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	POP8	P38208	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YNL046W	P53956	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MSA1	Q08471	629 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YPT10	P38146	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YER181C	P40097	107 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MIM1	Q08176	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	ATG15	P25641	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YER134C	P40081	178 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SYS1	P41544	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	GEP7	P53171	287 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	SWM1	Q12379	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPT2	YKR067W	Q0255	P03881	472 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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