RNA–Protein interactions for RNA: YJL099W

CHS6, Transcript of Member of the ChAPs (Chs5p-Arf1p-binding proteins) family, yeast

Gene CHS6, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CHS6	YJL099W	CSH1	P38287	376 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YJL009W	P47078	108 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YGL193C	P53097	103 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	HSK3	P69852	69 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	FMN1	Q03778	218 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YDR102C	Q03864	110 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	AVO2	Q04749	426 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	IRC21	Q04772	201 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	GRE1	Q08969	168 aa		0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	PEX34	P25584	144 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YBR027C	P38220	110 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	APQ12	P40532	138 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	GPI2	P46961	280 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	CCC1	P47818	322 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RCF2	P53721	224 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	PRM3	Q08931	133 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	MGR2	Q02889	113 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	NSL1	Q12143	216 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	HUT1	Q12520	339 aa		0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	AME1	P38313	324 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YER181C	P40097	107 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	ORM1	P53224	222 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	SED1	Q01589	338 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RAV2	Q03956	351 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	GPI11	Q06636	219 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	IRC19	Q07843	230 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RFU1	Q08003	200 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	KTI11	Q3E840	82 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	COA6	Q3E846	104 aa		0.24	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	PHO13	P19881	312 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	SRP21	P32342	167 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	HSP150	P32478	413 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	DER1	P38307	211 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	IPT1	P38954	527 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YER121W	P40076	114 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	FIP1	P45976	327 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	EST3	Q03096	181 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	HSL1	P34244	1518 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	FUN14	P18411	198 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.23	□□□□□ -2.37	not detected
CHS6	YJL099W	HHY1	P39982	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YMR141C	P40211	102 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	SPG1	P50088	95 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	MRS4	P23500	304 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	FIG1	P38224	298 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	SLM6	P38343	150 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RAF1	Q06891	181 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YPR202W	Q08993	238 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	MHF1	Q3E835	90 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	HFA1	P32874	2273 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	PFY1	P07274	126 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	ANB1	P19211	157 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YHR140W	P38842	239 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	YNL019C	P53975	284 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	TLG1	Q03322	224 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	SEN15	Q04675	128 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	NAT5	Q08689	176 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	RIB3	Q99258	208 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	MED11	Q99278	115 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CHS6	YJL099W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	MRPL44	P19956	98 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	DIE2	P50076	525 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	YDR366C	P87287	132 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	PET20	Q99373	253 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	HHO1	P53551	258 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	ATP14	Q12349	124 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	YOR1	P53049	1477 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	YHR213W	P0CI67	198 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CHS6	YJL099W	PHB1	P40961	287 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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