RNA–Protein interactions for RNA: YGR225W

AMA1, Transcript of Activator of meiotic anaphase promoting complex (APC/C), yeast

Gene AMA1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMA1	YGR225W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	MST28	P39552	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YNR048W	P53740	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	MIX17	Q03667	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	LIP2	Q06005	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	JID1	Q12350	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	BLM10	P43583	2143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	MSN1	P22148	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YKL044W	P36092	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	MCH2	P36032	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	MOH1	P38191	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	UBS1	P38290	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YPI1	P43587	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YHM2	Q04013	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	GEP3	Q08622	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	TIM18	Q08749	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	SUT2	Q12286	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	ERG8	P24521	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	BNA2	P47125	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	SDH7	Q04401	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	MDM10	P18409	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	APS1	P35181	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	SFT2	P38166	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YHR173C	P38864	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YCH1	P42937	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	RAV2	Q03956	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	GTO3	Q04806	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	HPF1	Q05164	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	IRC25	Q07951	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YPS3	Q12303	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	CYC3	P06182	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YKR041W	P36134	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YJL193W	P39542	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	NUP53	Q03790	475 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	ECM18	Q04623	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	GRE1	Q08969	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AMA1	YGR225W	FZF1	P32805	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YPL073C	P40323	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YIP3	P53633	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YLR460C	P54007	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	MRX11	Q03079	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	ATG33	Q06485	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	HPA2	Q06592	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	MRS3	P10566	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	SPC29	P33419	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	PAU7	P39545	55 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YER181C	P40097	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	HUA1	P40325	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YIL089W	P40500	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YFR045W	P43617	309 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YJL118W	P47022	219 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	ATG21	Q02887	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	KRE1	P17260	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YPS1	P32329	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	CSH1	P38287	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	EGT2	P42835	1041 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	API2	Q04413	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	MSA1	Q08471	629 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	HSP150	P32478	413 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
AMA1	YGR225W	OXA1	P39952	402 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	UBC13	P52490	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	TOM7	P53507	60 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YHP1	Q04116	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
AMA1	YGR225W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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