RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543128.5

CCDC189-205, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCDC189, Length 1,829 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-205ENST00000543128 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 NRCAMQ92823 1304 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 MICAL2O94851 1124 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 F2P00734 622 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 KRT3P12035 628 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 FGFR4P22455 802 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CAV1Q03135 178 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SREBF2Q12772 1141 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 MAP2K5Q13163 448 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ORC1Q13415 861 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CNGA2Q16280 664 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 HOOK3Q86VS8 718 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CCDC114Q96M63 670 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CPXM1Q96SM3 734 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CPA4Q9UI42 421 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 DERAQ9Y315 318 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 GPR32O75388 356 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 HMGCRP04035 888 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 GABRB2P47870 512 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PDCLQ13371 301 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SLC29A2Q14542 456 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 XYLT1Q86Y38 959 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 KIF12Q96FN5 646 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TRIP11Q15643 1979 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TJP3O95049 919 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 NPTXRO95502 500 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SHBGP04278 402 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 KAT2BQ92831 832 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 RIPK2O43353 540 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ERBB2P04626 1255 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ATF2P15336 505 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PSMA2P25787 234 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 GPD2P43304 727 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 LMNB2Q03252 620 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CROCCP2Q86T23 111 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TLCD1Q96CP7 247 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 AAASQ9NRG9 546 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 KRT10P13645 584 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TM4SF4P48230 202 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ADCY2Q08462 1091 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CCDC89Q8N998 374 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 BBOF1Q8ND07 529 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 RAPGEF5Q92565 580 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.92■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 M0QYV0 167 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 LIASO43766 372 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ADCY8P40145 1251 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 NDST1P52848 882 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ITGA8P53708 1063 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 MYO1EQ12965 1108 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 ZNF365Q70YC5 407 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 PGM2Q96G03 612 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC189-205ENST00000543128 SNX27Q96L92 541 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms