RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G COX10P21592 462 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G MRPL25P23369 157 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G EMP24P32803 203 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G SEC66P33754 206 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G YUH1P35127 236 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR137WP38276 179 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G RPF1P38805 295 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR173CP38864 112 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G CWP2P43497 92 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G KEG1P43614 200 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G DIE2P50076 525 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G PHO23P50947 330 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G CUS2P53830 285 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G AIM34Q03673 198 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G SDH7Q04401 133 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR224WQ05947 369 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G GGA1Q06336 557 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G TIM22Q12328 207 aa0.16□□□□□ -2.38
tF(GAA)GtF(GAA)G RFA3P26755 122 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G QRI5P32344 111 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G SCM4P32564 187 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G FMT1P32785 401 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G SNC2P33328 115 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G MIX23P38162 196 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G RRF1P38771 230 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G RPC10P40422 70 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YIL163CP40448 117 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data0.15□□□□□ -2.39not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G INA22P40576 216 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G HYR1P40581 163 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YJL144WP47009 104 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G OST3P48439 350 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G UBC11P52492 156 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YGR018CP53211 109 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YGR042WP53227 271 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G VPS75P53853 264 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G PGA1P53896 198 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YNL019CP53975 284 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G PMP3P87284 55 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G DCS1Q06151 350 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG17Q06410 417 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ARR3Q06598 404 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR053CQ12026 108 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G NFI1Q12216 726 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG31Q12421 196 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YPR145C-AQ2V2P0 78 aa0.15□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G THP2O13539 261 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ADH3P07246 375 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YGL041W-AP0C5N3 154 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YER039C-AP0CD97 72 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G SEC59P20048 519 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YCR022CP25620 114 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G VMA8P32610 256 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G VAM7P32912 316 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR016WP38216 128 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G UMP1P38293 148 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G SIC1P38634 284 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G MTW1P39731 289 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G THO1P40040 218 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G MPM1P40364 252 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YRB2P40517 327 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G TFG2P41896 400 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YJR111CP47148 283 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YGL193CP53097 103 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G BRP1P53194 125 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G FMP48P53233 369 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G HST4P53688 370 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G SPR6Q01684 191 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G SHR3Q02774 210 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ADD37Q03233 198 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YMD8Q03697 442 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G TY1A-MR1Q04215 440 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G RAD33Q04231 177 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ELP6Q04868 273 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ORM2Q06144 216 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G TSR2Q06672 205 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG41Q12048 136 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G RDI1Q12434 202 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YGL258W-AQ3E740 77 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G LSO1Q3E827 93 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G Q0032Q9ZZX7 96 aa0.14□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G MATALPHA1P0CY06 175 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G HMLALPHA1P0CY07 175 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G CPR1P14832 162 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G URA6P15700 204 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G CCA1P21269 546 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G YCR023CP25351 611 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G VMA5P31412 392 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ERG24P32462 438 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G ZRT1P32804 376 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G PRS1P32895 427 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G DUT1P33317 147 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G SHB17P36136 271 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G LAS1P36146 502 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data0.13□□□□□ -2.39not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G YFR045WP43617 309 aa0.13□□□□□ -2.39
tF(GAA)GtF(GAA)G DAN1P47178 298 aa0.13□□□□□ -2.39
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