RNA–Protein interactions for RNA: YDR545W

YRF1-1, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-1, Length 5,391 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-1YDR545W YHM2Q04013 314 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W MET32Q12041 191 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W ERS1P17261 260 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W IRC13Q08630 104 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W SCO1P23833 295 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W ECM33P38248 429 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W OSW5P40219 148 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YDR102CQ03864 110 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W LPP1Q04396 274 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W GEP3Q08622 556 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W RPL12BP0CX54 165 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YFL068WP0CX99 160 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YLL066W-AP0CY00 160 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YLL067W-AP0CY01 160 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YCR025CP25352 136 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W MTR2P34232 184 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YGP1P38616 354 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W THI72Q08579 599 aa6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W COX1P00401 534 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W CMC1P36064 111 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YJR015WP47090 510 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W DYN2Q02647 92 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W RPB7P34087 171 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W SOR1P35497 357 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YHR130CP38834 111 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W SOR2Q07786 357 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W ATP10P18496 279 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W ATF1P40353 525 aa6.62□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W VAR1P02381 398 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W MDM10P18409 493 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W PAU7P39545 55 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W POP3P53833 195 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W SAS2P40963 338 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YJR115WP47152 169 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YOS1Q3E834 85 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W UBS1P38290 277 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W NUD1P32336 851 aa6.61□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W SHO1P40073 367 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YGR269WP40326 108 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W UBC13P52490 153 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W DMA2P53924 522 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YLR422WQ06409 1932 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W DAT1P13483 248 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W VMA3P25515 160 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YNL184CP53876 108 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W RDL2Q08742 149 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YNL198CP40166 100 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W ATG4P53867 494 aa6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W RHO5P53879 331 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W PRS4P38063 326 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W SCW10Q04951 389 aa6.59□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W IRC25Q07951 179 aa6.59□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W QRI5P32344 111 aa6.59□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W YIL029CP40538 142 aa6.59□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
YRF1-1YDR545W PRE3P38624 215 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W PFS1P38872 237 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W DUT1P33317 147 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W VPS71Q03433 280 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W DIC1Q06143 298 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W ISD11Q6Q560 94 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W SPC29P33419 253 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W ECM14P38836 430 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YER181CP40097 107 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YGR050CP53231 118 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W BET5Q03630 159 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W ECM18Q04623 453 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W DSK2P48510 373 aa6.58□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W PCL1P24867 279 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YKL069WP36088 180 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W MST28P39552 234 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YFR045WP43617 309 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W FMP46P36141 133 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W SWD3P38123 315 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W POA1P38218 177 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W CCS1P40202 249 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W HPA2Q06592 156 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YCR075W-AQ3E830 75 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YFR054CP43622 192 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YOR292CQ08743 309 aa6.57□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YPT10P38146 199 aa6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YHR173CP38864 112 aa6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YER079WP40052 210 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W POM34Q12445 299 aa6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YFL065CP43539 102 aa6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W FHN1P53279 174 aa6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YPR203WQ08994 102 aa6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YPL073CP40323 161 aa6.55□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W SDH7Q04401 133 aa6.55□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa6.55□□□□□ -1.36
YRF1-1YDR545W YKL044WP36092 106 aa6.55□□□□□ -1.36
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