RNA–Protein interactions for RNA: Q0017

Q0017, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0017, Length 162 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0017Q0017 RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 YPR127WQ06494 345 aa-1.3□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 SEC14P24280 304 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 HTD2P38790 280 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 HSL1P34244 1518 aa-1.31□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 PAC10P48363 199 aa-1.32□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 YOL024WQ08172 172 aa-1.32□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 URA2P07259 2214 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 SPT14P32363 452 aa-1.33□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 CMC4Q3E7A9 73 aa-1.33□□□□□ -2.62
Q0017Q0017 GLC8P41818 229 aa-1.35□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 AIM34Q03673 198 aa-1.35□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 GIS3Q12418 502 aa-1.35□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 GSC2P40989 1895 aa-1.35□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 CBF1P17106 351 aa-1.36□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data-1.36□□□□□ -2.63not detected
Q0017Q0017 YNL200CP40165 246 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 YEL073CP39974 107 aa-1.37□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 YEL014CP39999 101 aa-1.37□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 YOR214CQ12282 236 aa-1.37□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 MPD1Q12404 318 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 SPS2P08459 502 aa-1.38□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 CDC39P25655 2108 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 RTC4P53850 401 aa-1.38□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 HSP150P32478 413 aa-1.39□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 YDL241WQ07738 123 aa-1.39□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 NQM1P53228 333 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
Q0017Q0017 RAD6P06104 172 aa-1.41□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 QCR7P00128 127 aa-1.42□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 TRX3P25372 127 aa-1.42□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 CSH1P38287 376 aa-1.42□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 PGA2P53903 129 aa-1.42□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 TAH1P25638 111 aaPredicted RBP-1.43□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 FMN1Q03778 218 aa-1.43□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 MATALPHA2P0CY08 210 aa-1.44□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 HMLALPHA2P0CY09 210 aa-1.44□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 HYP2P23301 157 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 GLR1P41921 483 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 RIB3Q99258 208 aa-1.44□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 TRM3Q07527 1436 aa-1.44□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 BNI1P41832 1953 aa-1.45□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 MVB12P42939 101 aa-1.45□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 INO4P13902 151 aa-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 YKL102CP34249 101 aa-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 ECM31P38122 312 aa-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 SOL1P50278 321 aa-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 YMR321CQ04898 105 aa-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 SHH4Q06236 168 aa-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 RAD9P14737 1309 aa-1.46□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 AHC2P25649 128 aa-1.47□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 YEL028WP39989 153 aa-1.47□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 YJL009WP47078 108 aa-1.47□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 HOP2P53187 214 aa-1.47□□□□□ -2.64
Q0017Q0017 TIM13P53299 105 aa-1.48□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 BRX1Q08235 291 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 UIP4Q08926 304 aa-1.49□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 RPL33AP05744 107 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 TTI2P47168 421 aa-1.5□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 LIP1Q03579 150 aa-1.5□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 SYM1Q06563 197 aa-1.5□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 HUG1Q6Q5K6 68 aa-1.51□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 IPT1P38954 527 aa-1.52□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 FMP32P43557 207 aa-1.52□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 RNH1Q04740 348 aa-1.53□□□□□ -2.65
Q0017Q0017 GRX8Q05926 109 aa-1.54□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 FAS2P19097 1887 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 ADE6P38972 1358 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 MYO1P08964 1928 aa-1.57□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 IRC21Q04772 201 aa-1.57□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 ATG10Q07879 167 aa-1.57□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 COA6Q3E846 104 aa-1.57□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 PHO13P19881 312 aa-1.58□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 YPR114WQ06107 315 aa-1.58□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 CAF4P36130 643 aa-1.59□□□□□ -2.66
Q0017Q0017 YKR041WP36134 250 aa-1.61□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 YPT31P38555 223 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 DIE2P50076 525 aa-1.61□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 FIT3Q08907 204 aa-1.61□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 NUF2P33895 451 aa-1.62□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 NVJ1P38881 321 aa-1.62□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 HPT1Q04178 221 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 NMA1Q06178 401 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 SPA2P23201 1466 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
Q0017Q0017 DDR48P18899 430 aaKnown RBP-1.66□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 YGL014C-AP0C5N1 53 aa-1.67□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 YNR064CP53750 290 aa-1.67□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 XPT1P47165 209 aa-1.68□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 YGL041W-AP0C5N3 154 aa-1.71□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 SRP102P36057 244 aaPredicted RBP-1.71□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 GPI11Q06636 219 aa-1.71□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 PEX34P25584 144 aa-1.72□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 SNO1Q03144 224 aa-1.72□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 YMR122CQ03879 124 aa-1.72□□□□□ -2.68
Q0017Q0017 RPB4P20433 221 aaPredicted RBP-1.73□□□□□ -2.69
Q0017Q0017 SHG1P38337 142 aa-1.73□□□□□ -2.69
Q0017Q0017 IPI1P38803 334 aaPredicted RBP-1.73□□□□□ -2.69
Q0017Q0017 RCF2P53721 224 aa-1.73□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50 ms