RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 EYSQ5T1H1 3165 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 MYO9BQ13459 2157 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM150BA6NC51 233 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 GMNCA6NCL1 334 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZBTB42B2RXF5 422 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 NCK2O43639 380 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 AKR1B10O60218 316 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 GSTA1P08263 222 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CASP4P49662 377 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPC3P51654 580 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNMA1Q12791 1236 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 IFT88Q13099 833 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 BSNDQ8WZ55 320 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 NT5C1BQ96P26 610 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 ASB7Q9H672 318 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMBIM4Q9HC24 238 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 INTUQ9ULD6 942 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM50BQ9Y247 325 aa10.61□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 MACROD2A1Z1Q3 448 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 MGRN1O60291 552 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 RTN2O75298 545 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 RB1P06400 928 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLTAP09496 248 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP1A2P50993 1020 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLHL30Q0D2K2 578 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 RIPK1Q13546 671 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTMR3Q13615 1198 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 LEXMQ3ZCV2 418 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 EPC2Q52LR7 807 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATF7IP2Q5U623 682 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRIM50Q86XT4 487 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR49Q8IV35 697 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 HACE1Q8IYU2 909 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 FIBCD1Q8N539 461 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC45Q96CN5 670 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCLT1Q96NL6 688 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 SQORQ9Y6N5 450 aa10.6□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 COL4A6Q14031 1691 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 SIP14410 1827 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 E7EVH7 732 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 H3BNC9 293 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAPPC3O43617 180 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADSSP30520 456 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNNC1P63316 161 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 GUCY1A3Q02108 690 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 GCNT1Q02742 428 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 LMNB2Q03252 620 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPM6BQ13491 265 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CUL1Q13616 776 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM192Q8IY95 271 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH2D3CQ8N5H7 860 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 NLRP7Q8WX94 980 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 BAP1Q92560 729 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 NOX5Q96PH1 765 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CGRRF1Q99675 332 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM213AQ9BRX8 229 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 GANQ9H2C0 597 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB20Q9NX57 234 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 DERAQ9Y315 318 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 TET1Q8NFU7 2136 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 KAT6AQ92794 2004 aa10.59□□□□□ -0.71
APOBEC3G-201ENST00000407997 VCANP13611 3396 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms