RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPI14P47088 403 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADO1P47143 340 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q TDA4P47153 279 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q DML1Q03652 475 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR031WQ07978 186 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOL014WQ08110 124 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q DAS2Q12084 232 aa-0.52□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q ROM2P51862 1356 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q POG1P40473 351 aa-0.53□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR342CQ12182 319 aa-0.53□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q YML100W-AQ8TGT0 57 aa-0.53□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q NCB2Q92317 146 aa-0.53□□□□□ -2.49
tW(UCA)QtW(UCA)Q ASF2P32448 525 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q CLG1P35190 452 aa-0.54□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.54□□□□□ -2.5not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q MGR2Q02889 113 aa-0.54□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q GPI17Q04080 534 aa-0.54□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q APS3P47064 194 aa-0.55□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG41Q12048 136 aa-0.55□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL183C-AQ3E765 70 aa-0.55□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YCR087C-AP37263 153 aa-0.56□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTC3P38804 111 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSA2P40078 261 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q TMA22P47089 198 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q PRP18P33411 251 aaPredicted RBP-0.57□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YER085CP40058 173 aa-0.57□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q RFC2P40348 353 aa-0.57□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS29BP41058 56 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q CCC1P47818 322 aa-0.57□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q NRK1P53915 240 aa-0.57□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATP20Q12233 115 aa-0.57□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q HAP2P06774 265 aa-0.58□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRT1P38192 103 aa-0.58□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YHR140WP38842 239 aa-0.58□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFL019CP43576 117 aa-0.58□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR412C-AQ3E742 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADE1P27616 306 aa-0.6□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPS18P32572 300 aa-0.6□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMP23P38231 175 aa-0.6□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q HTD2P38790 280 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q RFC4P40339 323 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q VAM10Q08474 114 aa-0.6□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.61□□□□□ -2.51not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q AVO2Q04749 426 aa-0.61□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q HRD1Q08109 551 aa-0.61□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q RUD3Q12234 484 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR381W-AQ3E804 55 aa-0.61□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDR157WA0A023PZE8 133 aa-0.62□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q STE18P18852 110 aa-0.62□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q YBR027CP38220 110 aa-0.62□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLM6P38343 150 aa-0.62□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q IKI1P38874 309 aa-0.62□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q RTR1P40084 226 aaPredicted RBP-0.62□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL194CP40169 301 aa-0.62□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q NHP6BP11633 99 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q UBC6P33296 250 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q NSG1P38837 291 aa-0.63□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD17P48581 401 aa-0.63□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q MRS1P07266 363 aa-0.64□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q YDL157CQ12082 118 aa-0.64□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLR422WQ06409 1932 aa-0.64□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q HSP30P25619 332 aa-0.65□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q OTU1P43558 301 aa-0.65□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q SBH1P52870 82 aa-0.65□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIM9Q04734 239 aa-0.65□□□□□ -2.51
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS25BP0C0T4 108 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q CBT1P36038 271 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q GLC8P41818 229 aa-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q PAC10P48363 199 aa-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q CWC23P52868 283 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q YML079WQ03629 201 aa-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q YMR321CQ04898 105 aa-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q YOR034C-AQ3E735 80 aa-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS25AQ3E792 108 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q GEP7P53171 287 aa-0.67□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q YNL184CP53876 108 aa-0.67□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAO3P40468 2376 aa-0.68□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC33P07260 213 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR269WP40326 108 aa-0.68□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q GAL83Q04739 417 aa-0.68□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPR014CQ6B0W2 109 aa-0.68□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIF1P29539 1916 aa-0.69□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q TAF2P23255 1407 aa-0.69□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q COQ1P18900 473 aa-0.69□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data-0.69□□□□□ -2.52not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q MVB12P42939 101 aa-0.69□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q PGA1P53896 198 aa-0.69□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q SOL1P50278 321 aa-0.7□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q VPS28Q02767 242 aa-0.7□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q FMN1Q03778 218 aa-0.7□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q RIB3Q99258 208 aa-0.7□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q BLM10P43583 2143 aa-0.71□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q SEC14P24280 304 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q RFA3P26755 122 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPS2P08459 502 aa-0.72□□□□□ -2.52
tW(UCA)QtW(UCA)Q PHO13P19881 312 aa-0.72□□□□□ -2.52
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