RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YPC1	P38298	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MST28	P39552	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	BXI1	P48558	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YPS5	P53057	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YGR151C	P53287	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	TRS23	Q03784	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	HFA1	P32874	2273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	CDC7	P06243	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	CPR3	P25719	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	MRP17	P28778	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	SNC2	P33328	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	LAG1	P38703	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	DLS1	P40366	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YIL029C	P40538	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	CUP9	P41817	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	YJR015W	P47090	510 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PGU1	P47180	361 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	RSM27	P53305	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	HRD1	Q08109	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VMA13	YPR036W	PHO2	P07269	559 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	LSB5	P25369	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	MRP49	P32388	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	AGA2	P32781	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	PDC2	P32896	925 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	SRY1	P36007	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	UMP1	P38293	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	OM14	P38325	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	COS8	P38723	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	SIM1	P40472	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	AVT7	P40501	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	HAC1	P41546	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YIP1	P53039	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	TSA2	Q04120	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	GEP5	Q12393	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	MSW1	P04803	379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	CDC50	P25656	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YBR220C	P38318	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	DFG10	P40526	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	EGT2	P42835	1041 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	BET5	Q03630	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	CNL1	Q06333	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	USV1	Q12132	391 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	RFM1	Q12192	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	COX5B	P00425	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	FMT1	P32785	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	TIR2	P33890	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	DOG2	P38773	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	DOG1	P38774	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YIL169C	P40442	995 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	IKS1	P47042	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	AVT4	P50944	713 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	TOS8	P53147	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YNL184C	P53876	108 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	AAH1	P53909	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	RNH201	P53942	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	FEX2	Q08991	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	MDH2	P22133	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	PEX22	P39718	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	REE1	P40893	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	UBC12	P52491	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	ATG39	Q06159	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	SYM1	Q06563	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	FEX1	Q08913	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	MCT1	Q12283	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	FLO9	P39712	1322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YCR041W	P37265	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	NAT2	P37293	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	SUR7	P54003	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	SDC1	Q03323	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VMA13	YPR036W	MIX14	Q04341	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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