RNA–Protein interactions for RNA: YOR085W

OST3, Transcript of Gamma subunit of the oligosaccharyltransferase complex of the ER lumen, yeast

Gene OST3, Length 1,053 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OST3	YOR085W	RCN1	P36054	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	DER1	P38307	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	YFL012W	P43580	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	YFR045W	P43617	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	SNX4	P47057	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	LPP1	Q04396	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	NSL1	Q12143	216 aa		4.66	□□□□□ -1.66
OST3	YOR085W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YBR063C	P38083	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	POP4	P38336	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	TRR2	P38816	342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	BBP1	Q12365	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	SNF4	P12904	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	CNB1	P25296	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YOX1	P34161	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	FMP32	P43557	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	NUF2	P33895	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	VMA22	P38784	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	NVJ1	P38881	321 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YAR068W	P39564	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	ICE2	P40499	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	APQ12	P40532	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	BOL2	P53082	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	SEC17	P32602	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	MRPS9	P38120	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	OST2	P46964	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YGL235W	P53071	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	NHP10	Q03435	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	GAS3	Q03655	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	ATG22	P25568	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	AHC2	P25649	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	GLE2	P40066	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	SOK1	P40317	901 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	SPC24	Q04477	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	PET20	Q99373	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	GPA2	P10823	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	HST4	P53688	370 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	RDI1	Q12434	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
OST3	YOR085W	HIS3	P06633	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YHR125W	P38831	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	ECO1	P43605	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	SBH2	P52871	88 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	AIM34	Q03673	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	ATG39	Q06159	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	CIN5	P40917	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	APS3	P47064	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YGR042W	P53227	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YDC1	Q02896	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	PSF1	Q12488	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	FMP23	P38231	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
OST3	YOR085W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	SWP1	Q02795	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	PLP1	Q04004	230 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	DYN3	Q04949	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	SCW10	Q04951	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	SHH4	Q06236	168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	REP2	P03872	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	Q0255	P03881	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	STP22	P25604	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	SKG1	P36169	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	COS6	P53344	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
OST3	YOR085W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.1 ms