RNA–Protein interactions for RNA: YOL078W

AVO1, Transcript of Component of a membrane-bound complex containing the Tor2p kinase, yeast

Gene AVO1, Length 3,531 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVO1	YOL078W	COQ2	P32378	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YHR140W	P38842	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	MTC6	P38849	526 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	RPR2	P40571	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
AVO1	YOL078W	OCA6	Q12454	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	PCL9	Q12477	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YGR018C	P53211	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	TDA4	P47153	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	APJ1	P53940	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	MAK31	P23059	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	RCN1	P36054	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	OST2	P46964	130 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YGR017W	P53210	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	AYT1	Q12226	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	MCP1	Q12106	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	MED6	P38782	295 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YGR015C	P53208	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	FMP42	Q04991	504 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	SUE1	Q06524	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YJL213W	P40896	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AVO1	YOL078W	SMP1	P38128	452 aa		4.59	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	AYR1	P40471	297 aa		4.59	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	LPP1	Q04396	274 aa		4.59	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	RNH202	Q05635	350 aa		4.59	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	ATP15	P21306	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	SFC1	P33303	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	TOD6	P34219	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YFL019C	P43576	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	PGU1	P47180	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	TSC3	Q3E790	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YNR062C	P53748	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	RSM10	Q03201	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	CTR2	P38865	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YER188W	P40103	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	VPS28	Q02767	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	SNC2	P33328	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	MRPL39	P36533	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	ATG18	P43601	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YDR366C	P87287	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	REP2	P03872	296 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	COX14	P39103	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	AIM2	P39721	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
AVO1	YOL078W	YGR039W	P53225	103 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	CHS7	P38843	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	GEP7	P53171	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	WSC2	P53832	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	AIM36	Q03798	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	ECM19	Q06011	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	GEP5	Q12393	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	MSA2	P36157	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	SRL3	P36167	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	MOB1	P40484	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	MDM34	P53083	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	TRP1	P00912	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	PHO89	P38361	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	NHP10	Q03435	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	RPB9	P27999	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YIL024C	P40543	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	OMA1	P36163	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YNL033W	P53964	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YNL019C	P53975	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	EAF3	Q12432	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	TIM17	P39515	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	FIS1	P40515	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	BUD25	P85052	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	GAS3	Q03655	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVO1	YOL078W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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