RNA–Protein interactions for RNA: YMR048W

CSM3, Transcript of Replication fork associated factor, yeast

Gene CSM3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSM3	YMR048W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	CUP2	P15315	225 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	APA2	P22108	325 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	RPB9	P27999	122 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	AIM29	P36154	155 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	UMP1	P38293	148 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YBR220C	P38318	560 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YBR242W	P38331	238 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YIL012W	P40551	113 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	TIR3	P40552	269 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	MRX5	P47007	382 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	UBC13	P52490	153 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YGL159W	P53110	370 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ERV29	P53337	310 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	PRM15	Q03262	622 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YDR248C	Q03786	193 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YDR102C	Q03864	110 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	VBA1	Q04301	562 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	FIT3	Q08907	204 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YOR385W	Q08909	290 aa		2.61	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	SPS2	P08459	502 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	GCN3	P14741	305 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ATG15	P25641	520 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	IMP1	P28627	190 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	SUA5	P32579	426 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	HPA3	P39979	161 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	BXI1	P48558	297 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	SBH2	P52871	88 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YMR252C	Q04814	134 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	KEI1	Q06346	221 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ATG41	Q12048	136 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	MED4	Q12343	284 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	DGK1	Q12382	290 aa		2.6	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	COX5B	P00425	151 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ARG80	P07249	177 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	PEX4	P29340	183 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YUH1	P35127	236 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ECM31	P38122	312 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	RRF1	P38771	230 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YGL185C	P53100	379 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	RSM27	P53305	110 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YLR283W	Q05867	314 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YLR031W	Q07978	186 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	YOR186W	Q08560	144 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	SCP1	Q08873	200 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	BBP1	Q12365	385 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	ATG40	Q99325	256 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	PET20	Q99373	253 aa		2.59	□□□□□ -1.99
CSM3	YMR048W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	FMP27	Q06179	2628 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	MRP17	P28778	131 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	YBL010C	P32788	280 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	CPR5	P35176	225 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	YER121W	P40076	114 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	DIE2	P50076	525 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	SOL1	P50278	321 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	GEP7	P53171	287 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	YGR042W	P53227	271 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	MRPL50	P53724	139 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	YMR279C	Q03263	540 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	DPP1	Q05521	289 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	ARR2	Q06597	130 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	HRD1	Q08109	551 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	CSF1	Q12150	2958 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	ATG31	Q12421	196 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	RDI1	Q12434	202 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	ODC2	Q99297	307 aa		2.58	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	ATG22	P25568	528 aa		2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	AGA2	P32781	87 aa		2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	SHG1	P38337	142 aa		2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	FLX1	P40464	311 aa		2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	CAT5	P41735	233 aa		2.57	□□□□□ -2
CSM3	YMR048W	TTI2	P47168	421 aa		2.57	□□□□□ -2

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