RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	YFR054C	P43622	192 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YGR050C	P53231	118 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	PGA1	P53896	198 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	AAH1	P53909	347 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	BSC1	Q12140	328 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.31	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	TIR1	P10863	254 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	SEC17	P32602	292 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	UTH1	P36135	365 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	CAB4	P53332	305 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	VPS71	Q03433	280 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	NHP10	Q03435	203 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	MRX8	Q05473	314 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	IRA2	P19158	3079 aa		4.3	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	SEC59	P20048	519 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YEL028W	P39989	153 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	CFD1	P40558	293 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	RPA43	P46669	326 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	FSH2	Q05015	223 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	MIM1	Q08176	113 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	SPC3	Q12133	184 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.29	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	ATS1	P31386	333 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	SRP21	P32342	167 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	TIM17	P39515	158 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	APJ1	P53940	528 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	SWC7	Q06707	132 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	ATG10	Q07879	167 aa		4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
YMD8	YML038C	Q0255	P03881	472 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	IMP1	P28627	190 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	HOT13	P36078	116 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	CSH1	P38287	376 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	GPI2	P46961	280 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	CIS3	P47001	227 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	COS10	P52924	374 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	SDS23	P53172	527 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	VPS28	Q02767	242 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	TEL1	P38110	2787 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	VAR1	P02381	398 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	LDS1	P31379	325 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	SMP1	P38128	452 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YGL088W	P53151	121 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	INP1	Q03694	420 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	VHS1	Q03785	461 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	OCA6	Q12454	224 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	CCA1	P21269	546 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YCR025C	P25352	136 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	PTC1	P35182	281 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	GGC1	P38988	300 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	PRM5	P40476	318 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YJL213W	P40896	331 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	SNM1	P40993	198 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	SFT1	P43682	97 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	FMP48	P53233	369 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YNL033W	P53964	284 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YNL019C	P53975	284 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	KTI11	Q3E840	82 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	SPS2	P08459	502 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	MIX23	P38162	196 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	PHO89	P38361	574 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	FLO5	P38894	1075 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	YIL012W	P40551	113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	FIP1	P45976	327 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YMD8	YML038C	TTI2	P47168	421 aa		4.24	□□□□□ -1.73

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