RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	EMC6	Q12431	108 aa		1.59	□□□□□ -2.15
CSE4	YKL049C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		1.59	□□□□□ -2.15
CSE4	YKL049C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		1.59	□□□□□ -2.15
CSE4	YKL049C	COX5A	P00424	153 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ARG80	P07249	177 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MER1	P16523	270 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	FUN14	P18411	198 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PBN1	P25580	416 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YCR102C	P25608	368 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MRPL37	P36532	105 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SHG1	P38337	142 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YHL026C	P38740	315 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	POG1	P40473	351 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	EMC5	P40540	141 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CAT5	P41735	233 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	DOC1	P53068	250 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	AAH1	P53909	347 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SNO1	Q03144	224 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	EMI1	Q04406	187 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RNH1	Q04740	348 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	GRX8	Q05926	109 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	BOP2	Q06150	570 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YLR173W	Q06247	608 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ANT1	Q06497	328 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CTR3	Q06686	241 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	FYV7	Q12247	151 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MHT1	Q12525	324 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		1.58	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	LAA1	P39526	2014 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	KIN28	P06242	306 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MSF1	P08425	469 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	APA2	P22108	325 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YCR101C	P25607	182 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SCM4	P32564	187 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	1.57	□□□□□ -2.16	not detected
CSE4	YKL049C	ERV15	P38312	142 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CUE1	P38428	203 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MEP1	P40260	492 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MPM1	P40364	252 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CIN5	P40917	295 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	VMA21	P41806	77 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PRM10	P42946	383 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	NUP57	P48837	541 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ERV14	P53173	138 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SAE3	P89114	91 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	FIT1	Q04433	528 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SEN15	Q04675	128 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	RAD28	Q12021	506 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	BTS1	Q12051	335 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YCT1	Q12235	531 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPR011C	Q12251	326 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PSF1	Q12488	208 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	COA6	Q3E846	104 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		1.57	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YPK2	P18961	677 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	CWP1	P28319	239 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	DOA4	P32571	926 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SNC2	P33328	115 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	SFK1	P35735	353 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YOR062C	P36025	268 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PAU24	P38155	120 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	LDB7	P38210	180 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	IRC22	P40006	225 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	AGE2	P40529	298 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PAM16	P42949	149 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YJL118W	P47022	219 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YJR056C	P47115	236 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	YGR042W	P53227	271 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	PAU12	P53343	120 aa		1.56	□□□□□ -2.16
CSE4	YKL049C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	1.56	□□□□□ -2.16

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