RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	NSG1	P38837	291 aa		0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	PGA1	P53896	198 aa		0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	NRK1	P53915	240 aa		0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	GRX5	Q02784	150 aa		0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	DAS2	Q12084	232 aa		0.74	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	SEN2	P16658	377 aa		0.73	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	YGL235W	P53071	178 aa		0.73	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	PIR1	Q03178	341 aa		0.73	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.73	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	DGK1	Q12382	290 aa		0.73	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	STF2	P16965	84 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	ADE1	P27616	306 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	UGX2	P32772	223 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	YBL010C	P32788	280 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	CAF4	P36130	643 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	YHL037C	P38733	133 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	SBH2	P52871	88 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	ATP20	Q12233	115 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.72	□□□□□ -2.29
LRP1	YHR081W	MAK31	P23059	88 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	TRX3	P25372	127 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	RRT1	P38192	103 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	MPM1	P40364	252 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	FMP32	P43557	207 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	SBH1	P52870	82 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	AIM34	Q03673	198 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YHP1	Q04116	353 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	FYV12	Q08559	129 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.71	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YLR422W	Q06409	1932 aa		0.7	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	AHC2	P25649	128 aa		0.7	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	ETR1	P38071	380 aa		0.7	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	SHG1	P38337	142 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YIL102C	P40488	101 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	NSE4	P43124	402 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YFL051C	P43552	160 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	DCV1	P43595	202 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	DML1	Q03652	475 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	FIT1	Q04433	528 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	UPS1	Q05776	175 aa		0.69	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	RAD9	P14737	1309 aa		0.68	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.68	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	HSP30	P25619	332 aa		0.68	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.68	□□□□□ -2.3	not detected
LRP1	YHR081W	GAL83	Q04739	417 aa		0.68	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	ATG41	Q12048	136 aa		0.68	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	GRX8	Q05926	109 aa		0.67	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	SHH4	Q06236	168 aa		0.67	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	CCW12	Q12127	133 aa		0.67	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YKL102C	P34249	101 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YAR064W	P39563	99 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	RFC2	P40348	353 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	HHT1	P61830	136 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	VPS28	Q02767	242 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	GPI17	Q04080	534 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	ELP6	Q04868	273 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YET3	Q07451	203 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.66	□□□□□ -2.3
LRP1	YHR081W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.65	□□□□□ -2.31	not detected
LRP1	YHR081W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YJR015W	P47090	510 aa		0.65	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.65	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.65	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.65	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	TIM13	P53299	105 aa		0.64	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	RIM9	Q04734	239 aa		0.64	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YGL230C	P53074	147 aa		0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	HOP2	P53187	214 aa		0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YDC1	Q02896	317 aa		0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	SNO1	Q03144	224 aa		0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YKR041W	P36134	250 aa		0.62	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	NVJ1	P38881	321 aa		0.62	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	TTI2	P47168	421 aa		0.62	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	JAC1	P53193	184 aa		0.62	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	KEI1	Q06346	221 aa		0.62	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	RAD6	P06104	172 aa		0.61	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	APA2	P22108	325 aa		0.61	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	ATP7	P30902	174 aa		0.61	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	CPR5	P35176	225 aa		0.61	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	CLG1	P35190	452 aa		0.61	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	YEL073C	P39974	107 aa		0.61	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	MOB1	P40484	314 aa		0.61	□□□□□ -2.31
LRP1	YHR081W	XPT1	P47165	209 aa		0.61	□□□□□ -2.31

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.5 ms