RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	OPI3	P05375	206 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YMC1	P32331	307 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	UTR5	P32630	166 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PRM5	P40476	318 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	BET5	Q03630	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	GAS3	Q03655	524 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PRM3	Q08931	133 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YSC84	P32793	468 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ZRT1	P32804	376 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	VMA11	P32842	164 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ATG12	P38316	186 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YIL165C	P40446	119 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ATG27	P46989	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YNL033W	P53964	284 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YNL019C	P53975	284 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YDR029W	Q12111	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	COX1	P00401	534 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YBR032W	P38223	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YIA6	P40556	373 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	AIM25	P47140	327 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	BXI1	P48558	297 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	FIT3	Q08907	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YPL264C	Q08980	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SNF4	P12904	322 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
MSC7	YHR039C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SRP21	P32342	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YKL102C	P34249	101 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	GPX2	P38143	162 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MED6	P38782	295 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YHR140W	P38842	239 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MST28	P39552	234 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	VMA21	P41806	77 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YNL320W	P42840	284 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	TOS8	P53147	276 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	IES4	Q08561	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MCA1	Q08601	432 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MED11	Q99278	115 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MRS3	P10566	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MDM10	P18409	493 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	NCE103	P53615	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PGA1	P53896	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	NUP100	Q02629	959 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	FLO11	P08640	1367 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ECM12	O13529	151 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MSI1	P13712	422 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	FLX1	P40464	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MST27	P53176	234 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YGR164W	P53291	111 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	FIT1	Q04433	528 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	HRT1	Q08273	121 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	DGA1	Q08650	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	HKR1	P41809	1802 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	NNK1	P36003	928 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	MBB1	P39534	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YAR029W	P39549	74 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	CWP2	P43497	92 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	PET191	Q02772	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	GRX5	Q02784	150 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MSC7	YHR039C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	CUP9	P41817	306 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	GPI2	P46961	280 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	MCH4	Q08268	501 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MSC7	YHR039C	EAF3	Q12432	401 aa		4.09	□□□□□ -1.76

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