RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	YFL051C	P43552	160 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	RTC4	P53850	401 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.85	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	ADE1	P27616	306 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YHL037C	P38733	133 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YGL235W	P53071	178 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	CGR1	P53188	120 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.84	□□□□□ -2.27
RSM27	YGR215W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	UBC8	P28263	218 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YBR242W	P38331	238 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	ATP20	Q12233	115 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.83	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	NSG1	P38837	291 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	MPM1	P40364	252 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	SBH2	P52871	88 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	AIM34	Q03673	198 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	UPS1	Q05776	175 aa		0.82	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	FIT1	Q04433	528 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	DAS2	Q12084	232 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.81	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	PGA1	P53896	198 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	ELP6	Q04868	273 aa		0.8	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	UGX2	P32772	223 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	CAF4	P36130	643 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	ETR1	P38071	380 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	RRT1	P38192	103 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	NSE4	P43124	402 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	NRK1	P53915	240 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	GAL83	Q04739	417 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		0.79	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	APA2	P22108	325 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YBL010C	P32788	280 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YHP1	Q04116	353 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	GRX8	Q05926	109 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	DGK1	Q12382	290 aa		0.78	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
RSM27	YGR215W	YAR064W	P39563	99 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	DML1	Q03652	475 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	ATG41	Q12048	136 aa		0.77	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.76	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	YIL102C	P40488	101 aa		0.75	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	HHT1	P61830	136 aa		0.75	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	SHH4	Q06236	168 aa		0.75	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.74	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	JIP3	O13555	125 aa		0.74	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	AHC2	P25649	128 aa		0.74	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	CPR5	P35176	225 aa		0.74	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	CCW12	Q12127	133 aa		0.74	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	HFA1	P32874	2273 aa		0.74	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	HSP30	P25619	332 aa		0.73	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	YKL102C	P34249	101 aa		0.73	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	VPS28	Q02767	242 aa		0.73	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	RIM9	Q04734	239 aa		0.73	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	DCV1	P43595	202 aa		0.72	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	GRX5	Q02784	150 aa		0.72	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	SNO1	Q03144	224 aa		0.72	□□□□□ -2.29
RSM27	YGR215W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	FMP32	P43557	207 aa		0.71	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	AVO2	Q04749	426 aa		0.71	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		0.71	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	YKR041W	P36134	250 aa		0.7	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	SHG1	P38337	142 aa		0.7	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	RFC2	P40348	353 aa		0.7	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	GPI17	Q04080	534 aa		0.7	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	MAK31	P23059	88 aa		0.69	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	SOL1	P50278	321 aa		0.69	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	YKR005C	Q02203	525 aa		0.69	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.68	□□□□□ -2.3	not detected
RSM27	YGR215W	YOR214C	Q12282	236 aa		0.68	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	NVJ1	P38881	321 aa		0.67	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	MOB1	P40484	314 aa		0.67	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	YJR015W	P47090	510 aa		0.67	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	HOP2	P53187	214 aa		0.67	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	GRX3	Q03835	250 aa		0.66	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	GRE1	Q08969	168 aa		0.66	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	RIF1	P29539	1916 aa		0.66	□□□□□ -2.3
RSM27	YGR215W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.65	□□□□□ -2.31	not detected
RSM27	YGR215W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	YPR127W	Q06494	345 aa		0.65	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	RAD6	P06104	172 aa		0.64	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	TTI2	P47168	421 aa		0.64	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	TIM13	P53299	105 aa		0.64	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	HRD1	Q08109	551 aa		0.64	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.64	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	FCY1	Q12178	158 aa		0.64	□□□□□ -2.31
RSM27	YGR215W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31

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