RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	APQ12	P40532	138 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	ALG13	P53178	202 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PAU10	Q03050	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SYM1	Q06563	197 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PAU20	Q08322	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YOR376W	Q08900	122 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SWT1	Q12104	458 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	JID1	Q12350	301 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PAU9	Q3E770	120 aa		3.15	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	HIP1	P06775	603 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YEL028W	P39989	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SAS2	P40963	338 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	CIN2	P46670	268 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PRY1	P47032	299 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	MIC27	P50945	234 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	AIM11	P87275	137 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	BET5	Q03630	159 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YMR082C	Q04276	118 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YPR071W	Q12346	211 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	ATG40	Q99325	256 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	HEM4	P06174	275 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	CDC26	P14724	124 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SPS18	P32572	300 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SGE1	P33335	543 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	INM1	P38710	295 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YJL118W	P47022	219 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SBH1	P52870	82 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	CDH1	P53197	566 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PGA1	P53896	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RAV2	Q03956	351 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RIM9	Q04734	239 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	ERF2	Q06551	359 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YOL073C	Q08232	322 aa		3.14	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	MKK1	P32490	508 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	VMA11	P32842	164 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	IXR1	P33417	597 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	ECM14	P38836	430 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YNL194C	P40169	301 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
XRS2	YDR369C	YIP5	P53108	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YLR296W	Q05898	108 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	IES4	Q08561	116 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PEX11	Q12462	236 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	UBA3	Q99344	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YGL010W	P25338	174 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RPB7	P34087	171 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	GPX1	P36014	167 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YIL169C	P40442	995 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SDP1	P40479	209 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YFR045W	P43617	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YPR096C	O13587	100 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	BET2	P20133	325 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	WSC2	P53832	503 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	UPS1	Q05776	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RRG8	Q06109	277 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	KTI11	Q3E840	82 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	CWP2	P43497	92 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YFR057W	P43625	151 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	TOS2	P50078	622 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YGR039W	P53225	103 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YNR064C	P53750	290 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YPL229W	Q99395	206 aa		3.12	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	PHO85	P17157	305 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	CUP9	P41817	306 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YJR124C	P47159	448 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	GEP7	P53171	287 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	MET31	Q03081	177 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YDR344C	Q05510	147 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	STP3	Q05937	343 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.11	□□□□□ -1.91
XRS2	YDR369C	ODC2	Q99297	307 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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