RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514344.5

CHD1-211, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHD1, Length 2,955 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1-211ENST00000514344 CCL26Q9Y258 94 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 DDX11L8A8MPP1 907 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 SOAT2O75908 522 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 GABRR2P28476 465 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 NMT1P30419 496 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 GJA4P35212 333 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 HOXD12P35452 270 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 SREBF1P36956 1147 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 MCM2P49736 904 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 ALLCQ8N6M5 410 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 FGF11Q92914 225 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 FAM83CQ9BQN1 747 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 GAREM1Q9H706 876 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 WDR70Q9NW82 654 aa3.6□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
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CHD1-211ENST00000514344 ALDH1A2O94788 518 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 EPHA5P54756 1037 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 AMPD2Q01433 879 aa3.59□□□□□ -1.83
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CHD1-211ENST00000514344 MAP7D1Q3KQU3 841 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 XKR3Q5GH77 459 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 USP49Q70CQ1 688 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 ANO5Q75V66 913 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 TMC8Q8IU68 726 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 TRIML1Q8N9V2 468 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 LEMD2Q8NC56 503 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 OLIG1Q8TAK6 271 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 CD101Q93033 1021 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 CEP89Q96ST8 783 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 LPIN3Q9BQK8 851 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 YIPF1Q9Y548 306 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 BACE2Q9Y5Z0 518 aa3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CHD1-211ENST00000514344 A0A1W2PQD8 194 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 SGK1O00141 431 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 TBX3O15119 743 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 TRAPPC3O43617 180 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 BRINP1O60477 761 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 GAS7O60861 476 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 CILPO75339 1184 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 RECQL4O94761 1208 aa3.59□□□□□ -1.84
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CHD1-211ENST00000514344 CR2P20023 1033 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 TMPRSS3P57727 454 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 BFSP1Q12934 665 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 DUSP4Q13115 394 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.843e-8■■■■■ 28.2
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CHD1-211ENST00000514344 ZNF654Q8IZM8 581 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 RIN3Q8TB24 985 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 USP33Q8TEY7 942 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 ACAP3Q96P50 834 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
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CHD1-211ENST00000514344 TPCN1Q9ULQ1 816 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa3.59□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 GDAQ9Y2T3 454 aa3.59□□□□□ -1.84
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CHD1-211ENST00000514344 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
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CHD1-211ENST00000514344 ARID2Q68CP9 1835 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 SMCO2A6NFE2 343 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 FOSP01100 380 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 HNF1BP35680 557 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 AVPR1AP37288 418 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 DPP6P42658 865 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 ADCY7P51828 1080 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 CYP4A11Q02928 519 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 NAB2Q15742 525 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 PTPRNQ16849 979 aa3.58□□□□□ -1.84
CHD1-211ENST00000514344 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.58□□□□□ -1.84
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