RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460605.1

GTPBP1-204, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-204	ENST00000460605	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	MED24	O75448	989 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	EDN1	P05305	212 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TYMP	P19971	482 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	DGKE	P52429	567 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	SMARCB1	Q12824	385 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	STRN3	Q13033	797 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	NR5A1	Q13285	461 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRIM29	Q14134	588 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	DMC1	Q14565	340 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	CEP120	Q8N960	986 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	CIT	O14578	2027 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	IGF2R	P11717	2491 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TAF4	O00268	1085 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	EGF	P01133	1207 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	CYP3A5	P20815	502 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PROZ	P22891	400 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	LRPAP1	P30533	357 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	NPTX2	P47972	431 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	GALK1	P51570	392 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PEX3	P56589	373 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	SCRN1	Q12765	414 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	NR1H3	Q13133	447 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	KYAT1	Q16773	422 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	EML5	Q05BV3	1969 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	DCLK1	O15075	740 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	CLDN3	O15551	220 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TOM1L1	O75674	476 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	ODC1	P11926	461 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	HOXC13	P31276	330 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	IRX4	P78413	519 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PSMD2	Q13200	908 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	DSE	Q9UL01	958 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	MAP3K13	O43283	966 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	PFKFB2	O60825	505 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	VNN2	O95498	520 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GTPBP1-204	ENST00000460605	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53

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