RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDTC1Q8N5D0 677 aa18.43■□□□□ 0.54
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF560Q96MR9 790 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TWNKQ96RR1 684 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PARP2Q9UGN5 583 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NFU1Q9UMS0 254 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 71.2
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NDST1P52848 882 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DR1Q01658 176 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SP3Q02447 781 aa18.43■□□□□ 0.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CNGA2Q16280 664 aa18.43■□□□□ 0.54
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