RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 BMP10O95393 424 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM253P0C7T8 217 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NFIAQ12857 509 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HLFQ16534 295 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PID1Q7Z2X4 250 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PLD3Q8IV08 490 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GZMAP12544 262 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NCAPHQ15003 741 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ADRM1Q16186 407 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ACCSLQ4AC99 568 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SDE2Q6IQ49 451 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 UCMAQ8WVF2 138 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HACL1Q9UJ83 578 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HEATR9A2RTY3 570 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM49P0CI25 452 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM49CP0CI26 452 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RARBP10826 455 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HLA-DPA1P20036 260 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PGM1P36871 562 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HMGCS2P54868 508 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MCL1Q07820 350 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 STX3Q13277 289 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MYBPC2Q14324 1141 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 AIFM3Q96NN9 605 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RAB27AP51159 221 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PTK7Q13308 1070 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SYNE4Q8N205 404 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 WHRNQ9P202 907 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TIMM44O43615 452 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SPP2Q13103 211 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SERPINB12Q96P63 405 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EHD4Q9H223 541 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 NMT2O60551 498 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 STAG3L1P0CL83 205 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PRKCEQ02156 737 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 STX5Q13190 355 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 WLSQ5T9L3 541 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 OOSP2Q86WS3 158 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 EVPLLA8MZ36 301 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 LARGE1O95461 756 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PSMD7P51665 324 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GTF2A2P52657 109 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ITGA9Q13797 1035 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 C19orf60Q96EN9 201 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MCEEQ96PE7 176 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 KLC4Q9NSK0 619 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RRN3Q9NYV6 651 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 IPPQ9Y573 584 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ALDH1A2O94788 518 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 RPA1P27694 616 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 COPAP53621 1224 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 CUL3Q13618 768 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 OXER1Q8TDS5 423 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 TBCBQ99426 244 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 REEP2Q9BRK0 252 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-201ENST00000356100 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms