RNA–Protein interactions for RNA: YNL165W

YNL165W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YNL165W, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL165W	YNL165W	PEX11	Q12462	236 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	KDX1	P36005	433 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	TVP38	P36164	337 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	AVT2	P39981	480 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	GPI17	Q04080	534 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	AME1	P38313	324 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	YKL102C	P34249	101 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	YNL217W	P40152	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	BOL2	P53082	120 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	ATG40	Q99325	256 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNL165W	YNL165W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	NSG1	P38837	291 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	MTW1	P39731	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	EAF6	P47128	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	RGM1	Q00453	211 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	YBR209W	P38311	105 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	YHR022C	P38763	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	RFC2	P40348	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	XPT1	P47165	209 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	RDI1	Q12434	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	YNR077C	P53758	84 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	CYT2	Q00873	224 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	MAK3	Q03503	176 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	NAT3	Q06504	195 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	NSL1	Q12143	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	SPO13	P23624	291 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	VPS71	Q03433	280 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	FIG1	P38224	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	DSE2	P38844	325 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	FCY21	P40039	528 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
YNL165W	YNL165W	AGE2	P40529	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	YFL019C	P43576	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	DGK1	Q12382	290 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNL165W	YNL165W	FZF1	P32805	299 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	DAN1	P47178	298 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	PDR18	P53756	1333 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	TFC1	P32367	649 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	DER1	P38307	211 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	YFH7	P43591	353 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	MPC3	P53311	146 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	SAY1	P53324	424 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	HSK3	P69852	69 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	SHH3	Q04487	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	TTI2	P47168	421 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	MDH2	P22133	377 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	NRG2	P38082	220 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	YGL235W	P53071	178 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	GAA1	P39012	614 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	CUP9	P41817	306 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	BUD25	P85052	153 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	MET5	P47169	1442 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	NUF2	P33895	451 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL165W	YNL165W	TIR1	P10863	254 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	YFR054C	P43622	192 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	TIM13	P53299	105 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	SML1	Q04964	104 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	AYR1	P40471	297 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	SPC25	P40014	221 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	PEP8	P40335	379 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	ANT1	Q06497	328 aa		4	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	PHO85	P17157	305 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	TVP23	P38962	199 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	SBH2	P52871	88 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	YGL101W	P53144	215 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	DAS2	Q12084	232 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YNL165W	YNL165W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.99	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.9 ms