RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C AGX1P43567 385 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YJL028WP47062 111 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C AIM25P47140 327 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SNN1P48232 102 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GPI8P49018 411 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NBP35P52920 328 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C TIM13P53299 105 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CAB4P53332 305 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GIM3P53900 129 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MET31Q03081 177 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ATC1Q04005 294 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C LDB18Q07887 179 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ATP14Q12349 124 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GIS3Q12418 502 aa1.61□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C UBR1P19812 1950 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C HIS1P00498 297 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CDC7P06243 507 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PET54P10834 293 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PET9P18239 318 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YCR099CP25657 155 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ADE1P27616 306 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C LHP1P33399 275 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C DRE2P36152 348 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C TVP38P36164 337 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YCR087C-AP37263 153 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RIB1P38066 345 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NRG2P38082 220 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C URA8P38627 578 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PRS3P38689 320 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C IKI1P38874 309 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PRM9P39551 298 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C EDC3P39998 551 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C LSM4P40070 187 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C AYR1P40471 297 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GNA1P43577 159 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PAC10P48363 199 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RAD17P48581 401 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ERV29P53337 310 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MNT4P53745 580 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YNL140CP53910 189 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CWC27Q02770 301 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GOT1Q03554 138 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SWC7Q06707 132 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YLR036CQ07986 203 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SCP1Q08873 200 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SPC3Q12133 184 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YLR046CQ12253 270 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C DGK1Q12382 290 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YLR099W-AQ3E798 87 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ECM29P38737 1868 aa1.6□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GSC2P40989 1895 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CDC28P00546 298 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SIR2P06700 562 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ERD2P18414 219 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRPL44P19956 98 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SEC59P20048 519 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PPH21P23594 369 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C AHC2P25649 128 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRP17P28778 131 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data1.59□□□□□ -2.15not detected
CSE4YKL049C OAC1P32332 324 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SEC17P32602 292 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SRY1P36007 326 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MRPL15P36523 253 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MAL32P38158 584 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C POP7P38291 140 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C BMT5P40493 336 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GLC8P41818 229 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GLR1P41921 483 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YGR201CP42936 225 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C TAD2P47058 250 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MDM34P53083 459 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YGL159WP53110 370 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MPC1P53157 130 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SAY1P53324 424 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MAL12P53341 584 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C HHO1P53551 258 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YNR062CP53748 327 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NRK1P53915 240 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SWS2P53937 143 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YCL001W-AP87012 153 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GAS3Q03655 524 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RUB1Q03919 77 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C DCR2Q05924 578 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ARR2Q06597 130 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RRT8Q08219 342 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RRP40Q08285 240 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GPM2Q12008 311 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PST1Q12355 444 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C JLP1Q12358 412 aa1.59□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GEP5Q12393 293 aa1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.6 ms