RNA–Protein interactions for RNA: YJL075C

APQ13, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene APQ13, Length 417 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APQ13	YJL075C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	BNA7	Q04066	261 aa		0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	FUS2	Q05670	677 aa		0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.54	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	COX8	P04039	78 aa		0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	HPA3	P39979	161 aa		0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	SER2	P42941	309 aa		0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	PGA2	P53903	129 aa		0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	SHH3	Q04487	196 aa		0.53	□□□□□ -2.32
APQ13	YJL075C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	OCH1	P31755	480 aa		0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	PAM17	P36147	197 aa		0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	MET31	Q03081	177 aa		0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	RNH202	Q05635	350 aa		0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	GGA1	Q06336	557 aa		0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	CNB1	P25296	175 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	STP22	P25604	385 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YLR460C	P54007	376 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	DAD4	P69851	72 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	RNH1	Q04740	348 aa		0.51	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	MRS1	P07266	363 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	UPS3	Q04006	179 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	IGO2	Q9P305	131 aa		0.5	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	TIR1	P10863	254 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	RPB7	P34087	171 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YER134C	P40081	178 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	CUP9	P41817	306 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	MMS2	P53152	137 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	FYV12	Q08559	129 aa		0.49	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YPK2	P18961	677 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	ARO7	P32178	256 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	UGX2	P32772	223 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	UBC12	P52491	188 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	SBH1	P52870	82 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YNL033W	P53964	284 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	DYN3	Q04949	312 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		0.48	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	MGT1	P26188	188 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	AHT1	P29589	182 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	SFK1	P35735	353 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	MTW1	P39731	289 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	YLR036C	Q07986	203 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.47	□□□□□ -2.33
APQ13	YJL075C	MRPL15	P36523	253 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	SPC25	P40014	221 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	VPS71	Q03433	280 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	NAT3	Q06504	195 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YLR031W	Q07978	186 aa		0.46	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	SEN2	P16658	377 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	PHO85	P17157	305 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	TRX3	P25372	127 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	UBC8	P28263	218 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YHL037C	P38733	133 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YGL235W	P53071	178 aa		0.45	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	QCR7	P00128	127 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	SNF4	P12904	322 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YCR023C	P25351	611 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	NTG1	P31378	399 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YFL051C	P43552	160 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	TDA4	P47153	279 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YNL184C	P53876	108 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	PIR1	Q03178	341 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YPR203W	Q08994	102 aa		0.44	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	RAD9	P14737	1309 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YFL019C	P43576	117 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	ARO80	Q04052	950 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YOL024W	Q08172	172 aa		0.43	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	YBR242W	P38331	238 aa		0.42	□□□□□ -2.34
APQ13	YJL075C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34

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