RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	MIA40	P36046	403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	UIP3	P39547	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YIL086C	P40503	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	LST7	P53237	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	DAD3	P69850	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	STP3	Q05937	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SEI1	Q06058	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	DIF1	O13577	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PDX1	P16451	410 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	STE4	P18851	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ELO2	P25358	347 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YKL102C	P34249	101 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SRX1	P36077	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YEL057C	P39983	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	GAT2	P40209	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YFL054C	P43549	646 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	FLO9	P39712	1322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	TCA17	P32613	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	COX15	P40086	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	CUP9	P41817	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	GPI2	P46961	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	CIS3	P47001	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	TTI2	P47168	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PCP1	P53259	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	STP4	Q07351	490 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	FRE7	Q12333	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	SWM1	Q12379	170 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	ATG40	Q99325	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSZ1	YHR064C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CUE1	P38428	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPB11	P38902	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YER010C	P40011	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	BNA2	P47125	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MRP51	Q02950	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RCE1	Q03530	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	FRQ1	Q06389	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RFU1	Q08003	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	HRD1	Q08109	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	HAP3	P13434	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	PCL1	P24867	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SWD3	P38123	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	FMO1	P38866	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CYB5	P40312	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YGR269W	P40326	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SNO3	P43544	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MSY1	P48527	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SPS18	P32572	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	UBS1	P38290	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	ATF1	P40353	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YGR050C	P53231	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	TRS23	Q03784	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	TSA2	Q04120	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SAG1	P20840	650 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YGL010W	P25338	174 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YBL059W	P34224	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	PSD1	P39006	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SHO1	P40073	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	PGU1	P47180	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	TRM9	P49957	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CRH1	P53301	507 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SUN4	P53616	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	STD1	Q02794	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	TVP18	Q04767	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SRP21	P32342	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	PAU16	P35994	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	DAD2	P36162	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YIL029C	P40538	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YIP5	P53108	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	GEP7	P53171	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	RPN14	P53196	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	MCH1	Q07376	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	YPS3	Q12303	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSZ1	YHR064C	CDC26	P14724	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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