RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 BFSP1Q12934 665 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAM9Q13443 819 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TMC2Q8TDI7 906 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TSG101Q99816 390 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR27A2RRH5 827 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PAPLNO95428 1278 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CCNE1P24864 410 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 AP3M2P53677 418 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 LRRC63Q05C16 580 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 NOTCH4Q99466 2003 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 OR6C75A6NL08 312 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CETN3O15182 167 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 RFPL2O75678 378 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMYND10O75800 440 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ABLIM3O94929 683 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ARPP19P56211 112 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 DLG4P78352 724 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ENPEPQ07075 957 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 MYO1EQ12965 1108 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 LIN9Q5TKA1 542 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR149Q86SP6 731 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 METTL23Q86XA0 190 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 HPDLQ96IR7 371 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 CDH22Q9UJ99 828 aa20.46■□□□□ 0.87
PACSIN3-208ENST00000531226 PTPRDP23468 1912 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 C8AP07357 584 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT13P13646 458 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 CPB1P15086 417 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 MTHFRP42898 656 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 VAMP7P51809 220 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 WSCD1Q658N2 575 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 TPGS2Q68CL5 300 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 L1RE1Q9UN81 338 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.45■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 IKBKBO14920 756 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 HUS1O60921 280 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 WEE2P0C1S8 567 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 ATF2P15336 505 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 ZP2Q05996 745 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 BIRC3Q13489 604 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 TRPC3Q13507 836 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 RTL10Q7L3V2 364 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 SPATA18Q8TC71 538 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 C5orf42Q9H799 3197 aa20.44■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 PHACTR2O75167 634 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 OR4Q2P0C623 313 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXA9P31269 272 aa20.43■□□□□ 0.86
PACSIN3-208ENST00000531226 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1123.9 ms