RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000095500.4

Ccdc78-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ccdc78, Length 1,651 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pyhin1Q8BV49 420 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ttc27Q8CD92 847 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mtnr1bQ8CIQ6 364 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gga1Q8R0H9 635 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 SarafQ8R3Q0 334 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Fthl17aQ9DAX0 182 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rnf6Q9DBU5 667 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 CenpkQ9ESN5 271 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tlr2Q9QUN7 784 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Htatip2Q9Z2G9 242 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 CitP49025 2055 aa11.66□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Piezo1E2JF22 2547 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ugt1a8D3Z748 530 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ugt1a10E9PXN7 530 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mmp15O54732 657 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Alkbh1P0CB42 389 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gdf7P43029 461 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Hoxd13P70217 339 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rhox12Q4TU81 186 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Grm6Q5NCH9 871 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cd6Q61003 665 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ift88Q61371 824 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Hdac10Q6P3E7 666 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Wdr35Q8BND3 1181 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 AagabQ8R2R3 316 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 AdigQ8R400 80 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pcdha9Q91Y11 979 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cldnd1Q9CQX5 253 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rbm31yQ9D3U4 565 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cfap45Q9D9U9 551 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Itga2bQ9QUM0 1033 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Piezo2Q8CD54 2822 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Col6a3E9PWQ3 3284 aa11.65□□□□□ -0.54
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Prdm12A2AJ77 365 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rap1gapA2ALS5 663 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Abcb5B5X0E4 1255 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm10110D3Z5M2 615 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 9330159F19RikD3Z623 648 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ass1P16460 412 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tnnc1P19123 161 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Bmp8aP34821 399 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Sox1P53783 391 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ugt1a2P70691 533 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Cdh8P97291 799 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 SlmapQ3URD3 845 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 LpoQ5SW46 710 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Slc20a1Q61609 681 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Dmc1Q61880 340 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ugt1a9Q62452 528 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ugt1a1Q63886 535 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gpr142Q7TQN9 365 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vat1lQ80TB8 417 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 AtripQ8BMG1 785 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Iqcb1Q8BP00 598 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Slfn5Q8CBA2 884 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Ndst4Q9EQW8 872 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Oxct2bQ9ESL0 520 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Oxct2aQ9JJN4 520 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa11.65□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Gm12394A2AKP6 982 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Calhm3J3QMI4 347 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Hcn4O70507 1186 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Enpp1P06802 906 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Chmp6P0C0A3 200 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Lmo2P25801 158 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Defa-rs12P50716 91 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 AdprhP54923 362 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Dsg1aQ61495 1057 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Znf12Q7TSI0 686 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rnf168Q80XJ2 565 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Elmo3Q8BYZ7 720 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Pdcd2lQ8C5N5 364 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Zbtb6Q8K088 423 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Tmprss4Q8VCA5 435 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Olfr348Q8VGK3 313 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Serpina9Q9D7D2 418 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Rnf25Q9QZR0 456 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Adam17Q9Z0F8 827 aa11.64□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Vwa8Q8CC88 1905 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Unc13dB2RUP2 1085 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Maml3D4QGC2 1135 aa11.63□□□□□ -0.55
Ccdc78-201ENSMUST00000095500 Stk10O55098 966 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.3 ms