Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Itga2bQ9QUM0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Itga2bQ9QUM0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Itga2bQ9QUM0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Itga2bQ9QUM0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Itga2bQ9QUM0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Itga2bQ9QUM0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Itga2bQ9QUM0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Itga2bQ9QUM0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Itga2bQ9QUM0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Itga2bQ9QUM0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Itga2bQ9QUM0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Itga2bQ9QUM0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Itga2bQ9QUM0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Itga2bQ9QUM0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Itga2bQ9QUM0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Itga2bQ9QUM0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Itga2bQ9QUM0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Itga2bQ9QUM0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Itga2bQ9QUM0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Itga2bQ9QUM0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Itga2bQ9QUM0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Itga2bQ9QUM0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Itga2bQ9QUM0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Itga2bQ9QUM0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Itga2bQ9QUM0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Itga2bQ9QUM0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Itga2bQ9QUM0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Itga2bQ9QUM0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Itga2bQ9QUM0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Itga2bQ9QUM0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Itga2bQ9QUM0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Itga2bQ9QUM0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Itga2bQ9QUM0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Itga2bQ9QUM0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Itga2bQ9QUM0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Itga2bQ9QUM0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Itga2bQ9QUM0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Itga2bQ9QUM0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Itga2bQ9QUM0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Itga2bQ9QUM0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Itga2bQ9QUM0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Itga2bQ9QUM0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Itga2bQ9QUM0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Itga2bQ9QUM0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Itga2bQ9QUM0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Itga2bQ9QUM0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Itga2bQ9QUM0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Itga2bQ9QUM0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Itga2bQ9QUM0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Itga2bQ9QUM0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Itga2bQ9QUM0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Itga2bQ9QUM0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Itga2bQ9QUM0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Itga2bQ9QUM0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Itga2bQ9QUM0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Itga2bQ9QUM0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Itga2bQ9QUM0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Itga2bQ9QUM0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Itga2bQ9QUM0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Itga2bQ9QUM0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Itga2bQ9QUM0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Itga2bQ9QUM0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Itga2bQ9QUM0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Itga2bQ9QUM0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Itga2bQ9QUM0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Itga2bQ9QUM0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Itga2bQ9QUM0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Itga2bQ9QUM0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Itga2bQ9QUM0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Itga2bQ9QUM0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Itga2bQ9QUM0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Itga2bQ9QUM0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Itga2bQ9QUM0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Itga2bQ9QUM0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Itga2bQ9QUM0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Itga2bQ9QUM0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Itga2bQ9QUM0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Itga2bQ9QUM0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Itga2bQ9QUM0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Itga2bQ9QUM0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Itga2bQ9QUM0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Itga2bQ9QUM0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Itga2bQ9QUM0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Itga2bQ9QUM0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Itga2bQ9QUM0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Itga2bQ9QUM0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Itga2bQ9QUM0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Itga2bQ9QUM0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Itga2bQ9QUM0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Itga2bQ9QUM0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Itga2bQ9QUM0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Itga2bQ9QUM0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Itga2bQ9QUM0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Itga2bQ9QUM0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Itga2bQ9QUM0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Itga2bQ9QUM0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Itga2bQ9QUM0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Itga2bQ9QUM0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Itga2bQ9QUM0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms