Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Mmp15O54732 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Mmp15O54732 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Mmp15O54732 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Mmp15O54732 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Mmp15O54732 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Mmp15O54732 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Mmp15O54732 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Mmp15O54732 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Mmp15O54732 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Mmp15O54732 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Mmp15O54732 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Mmp15O54732 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Mmp15O54732 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Mmp15O54732 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Mmp15O54732 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Mmp15O54732 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Mmp15O54732 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Mmp15O54732 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mmp15O54732 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Mmp15O54732 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Mmp15O54732 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Mmp15O54732 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Mmp15O54732 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Mmp15O54732 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Mmp15O54732 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Mmp15O54732 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Mmp15O54732 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Mmp15O54732 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Mmp15O54732 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Mmp15O54732 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Mmp15O54732 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Mmp15O54732 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Mmp15O54732 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Mmp15O54732 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Mmp15O54732 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Mmp15O54732 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Mmp15O54732 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Mmp15O54732 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Mmp15O54732 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Mmp15O54732 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Mmp15O54732 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Mmp15O54732 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Mmp15O54732 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Mmp15O54732 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Mmp15O54732 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Mmp15O54732 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Mmp15O54732 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Mmp15O54732 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Mmp15O54732 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Mmp15O54732 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Mmp15O54732 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Mmp15O54732 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mmp15O54732 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Mmp15O54732 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Mmp15O54732 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Mmp15O54732 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Mmp15O54732 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Mmp15O54732 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Mmp15O54732 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Mmp15O54732 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Mmp15O54732 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Mmp15O54732 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Mmp15O54732 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Mmp15O54732 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Mmp15O54732 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Mmp15O54732 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Mmp15O54732 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Mmp15O54732 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Mmp15O54732 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Mmp15O54732 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Mmp15O54732 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Mmp15O54732 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Mmp15O54732 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Mmp15O54732 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Mmp15O54732 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Mmp15O54732 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mmp15O54732 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Mmp15O54732 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Mmp15O54732 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Mmp15O54732 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Mmp15O54732 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mmp15O54732 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Mmp15O54732 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mmp15O54732 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mmp15O54732 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Mmp15O54732 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Mmp15O54732 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Mmp15O54732 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Mmp15O54732 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mmp15O54732 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Mmp15O54732 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Mmp15O54732 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mmp15O54732 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Mmp15O54732 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Mmp15O54732 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Mmp15O54732 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Mmp15O54732 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mmp15O54732 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Mmp15O54732 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms