RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028696.4

Ddb2-201, Transcript of DNA damage-binding protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddb2, Length 1,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa14.92□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Klra10Q9R1G6 266 aa14.92□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa14.92□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Gm4846B2RWH8 538 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Gm10378F6XQQ1 160 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Oaz2O08608 189 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Abcb1bP06795 1276 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Ass1P16460 412 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Agxt2Q3UEG6 513 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Bbof1Q3V079 533 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Cfap97Q6ZPR1 541 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Thnsl1Q8BH55 747 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Lin9Q8C735 542 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Kremen2Q8K1S7 461 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Trim68Q8K243 485 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Atg13Q91YI1 516 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Tgs1Q923W1 853 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Pin4Q9CWW6 131 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Dock1Q8BUR4 1865 aa14.91□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 A0A286YCQ6 122 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Gm1661E9Q963 441 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Oas1aP11928 367 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Trim72Q1XH17 477 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 PtprcapQ64697 197 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Trim65Q8BFW4 522 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Aste1Q8BIR2 672 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Fam163bQ8BUM6 167 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Slc7a14Q8BXR1 771 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Rint1Q8BZ36 792 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Gtpbp10Q8K013 366 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Oas1gQ8K469 367 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 SarafQ8R3Q0 334 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Nmrk1Q91W63 195 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Tlr3Q99MB1 905 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Pcyox1Q9CQF9 505 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Lgals2Q9CQW5 130 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 SelenooQ9DBC0 667 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Tlr2Q9QUN7 784 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Rnf103Q9R1W3 683 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Padi3Q9Z184 664 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Slfn14V9GXG1 899 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Umodl1Q5DID3 1319 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Rap1gapA2ALS5 663 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Abcb5B5X0E4 1255 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Zfp651E9PZ11 729 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Olfr1354E9Q5G9 310 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Psmc3O88685 442 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Cdh8P97291 799 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Ptgs2Q05769 604 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Fut7Q11131 389 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Slc20a1Q61609 681 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Defa-rs10Q64263 91 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Snx19Q6P4T1 997 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Timd2Q8R183 305 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Kcnk13Q8R1P5 405 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 MlklQ9D2Y4 472 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 1700123K08RikQ9D991 295 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Nmnat1Q9EPA7 285 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Hmgn5Q9JL35 406 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Wdr54Q9R0D8 334 aa14.9□□□□□ -0.02
Ddb2-201ENSMUST00000028696 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Calhm3J3QMI4 347 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Scrg1O88745 98 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 AgtP11859 477 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Pik3caP42337 1068 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Dmc1Q61880 340 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Olfr1105Q7TR58 312 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Dnajc16Q80TN4 772 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 RragaQ80X95 313 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Znf830Q8R1N0 363 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Camkk1Q8VBY2 505 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Vps36Q91XD6 386 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Mfsd5Q921Y4 450 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Scyl3Q9DBQ7 735 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Oxct2bQ9ESL0 520 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Oxct2aQ9JJN4 520 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Tnni1Q9WUZ5 187 aa14.89□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Myo7aP97479 2215 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Szt2A2A9C3 3431 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Apol6B7ZC55 329 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 4933406M09RikG3XA12 479 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Wnt6P22727 364 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Sox5P35710 763 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Ppp3ccP48455 513 aa14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Ddb2-201ENSMUST00000028696 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 155.7 ms