Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
Atg13Q91YI1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Atg13Q91YI1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Atg13Q91YI1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Atg13Q91YI1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Atg13Q91YI1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Atg13Q91YI1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Atg13Q91YI1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atg13Q91YI1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Atg13Q91YI1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Atg13Q91YI1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Atg13Q91YI1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Atg13Q91YI1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Atg13Q91YI1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atg13Q91YI1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Atg13Q91YI1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Atg13Q91YI1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atg13Q91YI1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atg13Q91YI1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Atg13Q91YI1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Atg13Q91YI1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atg13Q91YI1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Atg13Q91YI1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Atg13Q91YI1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atg13Q91YI1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atg13Q91YI1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Atg13Q91YI1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atg13Q91YI1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Atg13Q91YI1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atg13Q91YI1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atg13Q91YI1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atg13Q91YI1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atg13Q91YI1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Atg13Q91YI1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Atg13Q91YI1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Atg13Q91YI1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Atg13Q91YI1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atg13Q91YI1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Atg13Q91YI1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Atg13Q91YI1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Atg13Q91YI1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Atg13Q91YI1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atg13Q91YI1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Atg13Q91YI1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atg13Q91YI1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atg13Q91YI1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atg13Q91YI1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Atg13Q91YI1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atg13Q91YI1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atg13Q91YI1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Atg13Q91YI1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Atg13Q91YI1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Atg13Q91YI1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Atg13Q91YI1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Atg13Q91YI1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atg13Q91YI1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atg13Q91YI1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atg13Q91YI1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atg13Q91YI1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atg13Q91YI1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atg13Q91YI1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atg13Q91YI1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atg13Q91YI1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atg13Q91YI1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Atg13Q91YI1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atg13Q91YI1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Atg13Q91YI1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Atg13Q91YI1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Atg13Q91YI1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Atg13Q91YI1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Atg13Q91YI1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Atg13Q91YI1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Atg13Q91YI1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Atg13Q91YI1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Atg13Q91YI1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atg13Q91YI1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atg13Q91YI1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atg13Q91YI1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Atg13Q91YI1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Atg13Q91YI1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Atg13Q91YI1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Atg13Q91YI1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Atg13Q91YI1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Atg13Q91YI1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Atg13Q91YI1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atg13Q91YI1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Atg13Q91YI1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Atg13Q91YI1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atg13Q91YI1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Atg13Q91YI1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Atg13Q91YI1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Atg13Q91YI1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Atg13Q91YI1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Atg13Q91YI1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Atg13Q91YI1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Atg13Q91YI1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Atg13Q91YI1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atg13Q91YI1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atg13Q91YI1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Atg13Q91YI1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms