Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,43■■■■■ 4,38
Atg13Q91YI1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,93
Atg13Q91YI1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Atg13Q91YI1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37,15■■■■□ 3,54
Atg13Q91YI1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,4■■■■□ 3,42
Atg13Q91YI1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Atg13Q91YI1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Atg13Q91YI1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Atg13Q91YI1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
Atg13Q91YI1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Atg13Q91YI1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Atg13Q91YI1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,87■■■■□ 3,17
Atg13Q91YI1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Atg13Q91YI1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Atg13Q91YI1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,51■■■■□ 3,12
Atg13Q91YI1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,43■■■■□ 3,1
Atg13Q91YI1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Atg13Q91YI1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Atg13Q91YI1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Atg13Q91YI1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,78■■■■□ 3
Atg13Q91YI1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Atg13Q91YI1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,69■■■□□ 2,98
Atg13Q91YI1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Atg13Q91YI1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Atg13Q91YI1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Atg13Q91YI1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Atg13Q91YI1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,87■■■□□ 2,85
Atg13Q91YI1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,7■■■□□ 2,83
Atg13Q91YI1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Atg13Q91YI1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Atg13Q91YI1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Atg13Q91YI1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Atg13Q91YI1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Atg13Q91YI1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Atg13Q91YI1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Atg13Q91YI1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Atg13Q91YI1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Atg13Q91YI1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Atg13Q91YI1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
Atg13Q91YI1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Atg13Q91YI1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Atg13Q91YI1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Atg13Q91YI1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Atg13Q91YI1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Atg13Q91YI1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Atg13Q91YI1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Atg13Q91YI1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,87■■■□□ 2,69
Atg13Q91YI1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Atg13Q91YI1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Atg13Q91YI1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,75■■■□□ 2,67
Atg13Q91YI1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Atg13Q91YI1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,67■■■□□ 2,66
Atg13Q91YI1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Atg13Q91YI1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Atg13Q91YI1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Atg13Q91YI1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Atg13Q91YI1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Atg13Q91YI1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,2■■■□□ 2,59
Atg13Q91YI1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Atg13Q91YI1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Atg13Q91YI1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Atg13Q91YI1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Atg13Q91YI1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Atg13Q91YI1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Atg13Q91YI1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Atg13Q91YI1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Atg13Q91YI1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Atg13Q91YI1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Atg13Q91YI1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Atg13Q91YI1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Atg13Q91YI1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Atg13Q91YI1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Atg13Q91YI1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Atg13Q91YI1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
Atg13Q91YI1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Atg13Q91YI1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Atg13Q91YI1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Atg13Q91YI1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Atg13Q91YI1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Atg13Q91YI1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Atg13Q91YI1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Atg13Q91YI1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Atg13Q91YI1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Atg13Q91YI1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Atg13Q91YI1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Atg13Q91YI1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Atg13Q91YI1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Atg13Q91YI1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Atg13Q91YI1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Atg13Q91YI1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Atg13Q91YI1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Atg13Q91YI1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Atg13Q91YI1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Atg13Q91YI1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Atg13Q91YI1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,41
Atg13Q91YI1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Atg13Q91YI1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Atg13Q91YI1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Atg13Q91YI1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Atg13Q91YI1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,6 ms