RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k9Q3U1V8 1077 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm13103Q4VAD2 491 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acvrl1Q61288 502 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Apol7cQ8C6E1 369 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hectd2Q8CDU6 774 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 McmbpQ8R3C0 642 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scarf2P59222 833 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Soat1Q61263 540 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dupd1Q8BK84 215 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rassf9Q8K342 435 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cetn2Q9R1K9 172 aa27.7■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rabgap1A2AWA9 1064 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lipo2D3YY49 398 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm44503E9PYU5 387 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prom1O54990 867 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RenbpP82343 430 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdca2Q14B71 982 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LnpkQ7TQ95 425 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q99KU6 348 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MafP54843 370 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnn2P58390 839 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 FaxcQ3UMF9 409 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dcaf15Q6PFH3 600 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Agap1Q8BXK8 857 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rell1Q8K2J7 272 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgd4Q91ZT5 766 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SncbQ91ZZ3 133 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cul2Q9D4H8 745 aa27.69■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddr1Q03146 911 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Runx2Q08775 607 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnga4Q3UW12 575 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt77Q6IFZ6 572 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RbakQ8BQC8 711 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trpc5Q9QX29 975 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sbno2Q7TNB8 1349 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lonrf1D3YY23 762 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Xbp1O35426 267 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tgfb2P27090 414 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hsd17b2P51658 381 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lig3P97386 1015 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnali1Q8BVN8 258 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trmt13Q8BYH3 481 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mamdc2Q8CG85 686 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smtnl2Q8CI12 456 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bcs1lQ9CZP5 418 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DmgdhQ9DBT9 869 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ParvaQ9EPC1 372 aa27.68■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm27029A2A4P4 543 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10801F7C7Q0 168 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Timm44O35857 452 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Oprl1P35377 367 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 St3gal1P54751 337 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smyd1P97443 490 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sh3bp2Q06649 559 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddr2Q62371 854 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atl2Q6PA06 583 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gtpbp10Q8K013 366 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tas1r3Q925D8 858 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prss23Q9D6X6 382 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il21rQ9JHX3 529 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Htra2Q9JIY5 458 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trpc3Q9QZC1 836 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Net1Q9Z206 595 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rap1gapA2ALS5 663 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup10A2BIN1 180 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup14A2CEK7 180 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup19A9C497 187 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup15A9R9W0 180 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup17B5X0G2 180 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup8E9PVW0 235 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup7E9QA79 235 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Banf1O54962 89 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup6P02762 180 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup1P11588 180 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mup2P11589 180 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PrkcbP68404 671 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uhmk1P97343 419 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smyd5Q3TYX3 416 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phactr4Q501J7 694 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Acot5Q6Q2Z6 421 aa27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PrphP15331 475 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smarcad1Q04692 1021 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5168Q4KL04 211 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nlrp4eQ66X19 978 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 RimklbQ80WS1 387 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp26Q99MX1 835 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smyd3Q9CWR2 428 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc5a4aQ9ET37 656 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgf15O35622 218 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ptk2P34152 1090 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rab21P35282 222 aa27.66■■■□□ 2.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxp2P58463 714 aa27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.5 ms