Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Apol7cQ8C6E1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Apol7cQ8C6E1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Apol7cQ8C6E1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Apol7cQ8C6E1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Apol7cQ8C6E1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Apol7cQ8C6E1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Apol7cQ8C6E1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Apol7cQ8C6E1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Apol7cQ8C6E1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Apol7cQ8C6E1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Apol7cQ8C6E1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Apol7cQ8C6E1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Apol7cQ8C6E1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Apol7cQ8C6E1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Apol7cQ8C6E1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Apol7cQ8C6E1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Apol7cQ8C6E1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Apol7cQ8C6E1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Apol7cQ8C6E1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Apol7cQ8C6E1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Apol7cQ8C6E1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Apol7cQ8C6E1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Apol7cQ8C6E1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Apol7cQ8C6E1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Apol7cQ8C6E1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Apol7cQ8C6E1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Apol7cQ8C6E1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Apol7cQ8C6E1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Apol7cQ8C6E1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Apol7cQ8C6E1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Apol7cQ8C6E1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Apol7cQ8C6E1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Apol7cQ8C6E1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Apol7cQ8C6E1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Apol7cQ8C6E1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Apol7cQ8C6E1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Apol7cQ8C6E1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Apol7cQ8C6E1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Apol7cQ8C6E1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Apol7cQ8C6E1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Apol7cQ8C6E1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Apol7cQ8C6E1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Apol7cQ8C6E1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apol7cQ8C6E1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Apol7cQ8C6E1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Apol7cQ8C6E1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apol7cQ8C6E1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apol7cQ8C6E1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apol7cQ8C6E1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apol7cQ8C6E1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apol7cQ8C6E1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apol7cQ8C6E1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apol7cQ8C6E1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apol7cQ8C6E1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Apol7cQ8C6E1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Apol7cQ8C6E1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apol7cQ8C6E1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apol7cQ8C6E1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apol7cQ8C6E1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Apol7cQ8C6E1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Apol7cQ8C6E1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apol7cQ8C6E1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apol7cQ8C6E1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apol7cQ8C6E1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apol7cQ8C6E1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apol7cQ8C6E1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Apol7cQ8C6E1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Apol7cQ8C6E1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Apol7cQ8C6E1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Apol7cQ8C6E1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Apol7cQ8C6E1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Apol7cQ8C6E1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Apol7cQ8C6E1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Apol7cQ8C6E1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Apol7cQ8C6E1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Apol7cQ8C6E1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apol7cQ8C6E1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Apol7cQ8C6E1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Apol7cQ8C6E1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Apol7cQ8C6E1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Apol7cQ8C6E1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Apol7cQ8C6E1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Apol7cQ8C6E1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Apol7cQ8C6E1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Apol7cQ8C6E1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Apol7cQ8C6E1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apol7cQ8C6E1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Apol7cQ8C6E1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Apol7cQ8C6E1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Apol7cQ8C6E1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Apol7cQ8C6E1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Apol7cQ8C6E1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apol7cQ8C6E1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Apol7cQ8C6E1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms