Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,69■■■■□ 3,62
Apol7cQ8C6E1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Apol7cQ8C6E1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Apol7cQ8C6E1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Apol7cQ8C6E1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Apol7cQ8C6E1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Apol7cQ8C6E1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Apol7cQ8C6E1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,26■■■□□ 2,92
Apol7cQ8C6E1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Apol7cQ8C6E1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,9■■■□□ 2,86
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Apol7cQ8C6E1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Apol7cQ8C6E1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Apol7cQ8C6E1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Apol7cQ8C6E1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Apol7cQ8C6E1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Apol7cQ8C6E1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Apol7cQ8C6E1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,94■■■□□ 2,7
Apol7cQ8C6E1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Apol7cQ8C6E1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Apol7cQ8C6E1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Apol7cQ8C6E1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Apol7cQ8C6E1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Apol7cQ8C6E1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Apol7cQ8C6E1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Apol7cQ8C6E1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Apol7cQ8C6E1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Apol7cQ8C6E1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
Apol7cQ8C6E1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Apol7cQ8C6E1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Apol7cQ8C6E1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Apol7cQ8C6E1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Apol7cQ8C6E1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Apol7cQ8C6E1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Apol7cQ8C6E1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Apol7cQ8C6E1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Apol7cQ8C6E1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Apol7cQ8C6E1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Apol7cQ8C6E1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Apol7cQ8C6E1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Apol7cQ8C6E1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Apol7cQ8C6E1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Apol7cQ8C6E1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Apol7cQ8C6E1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Apol7cQ8C6E1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Apol7cQ8C6E1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Apol7cQ8C6E1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Apol7cQ8C6E1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Apol7cQ8C6E1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Apol7cQ8C6E1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Apol7cQ8C6E1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Apol7cQ8C6E1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Apol7cQ8C6E1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Apol7cQ8C6E1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Apol7cQ8C6E1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Apol7cQ8C6E1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Apol7cQ8C6E1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Apol7cQ8C6E1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Apol7cQ8C6E1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Apol7cQ8C6E1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Apol7cQ8C6E1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Apol7cQ8C6E1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Apol7cQ8C6E1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Apol7cQ8C6E1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Apol7cQ8C6E1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Apol7cQ8C6E1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Apol7cQ8C6E1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Apol7cQ8C6E1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Apol7cQ8C6E1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Apol7cQ8C6E1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Apol7cQ8C6E1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
Apol7cQ8C6E1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Apol7cQ8C6E1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Apol7cQ8C6E1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Apol7cQ8C6E1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Apol7cQ8C6E1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Apol7cQ8C6E1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Apol7cQ8C6E1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Apol7cQ8C6E1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Apol7cQ8C6E1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Apol7cQ8C6E1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Apol7cQ8C6E1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Apol7cQ8C6E1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Apol7cQ8C6E1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Apol7cQ8C6E1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Apol7cQ8C6E1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Apol7cQ8C6E1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Apol7cQ8C6E1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Apol7cQ8C6E1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Apol7cQ8C6E1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Apol7cQ8C6E1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,89■■■□□ 2,21
Apol7cQ8C6E1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Apol7cQ8C6E1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Apol7cQ8C6E1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Apol7cQ8C6E1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Apol7cQ8C6E1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,4 ms