Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
SncbQ91ZZ3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
SncbQ91ZZ3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
SncbQ91ZZ3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
SncbQ91ZZ3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
SncbQ91ZZ3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
SncbQ91ZZ3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
SncbQ91ZZ3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
SncbQ91ZZ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
SncbQ91ZZ3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
SncbQ91ZZ3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
SncbQ91ZZ3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
SncbQ91ZZ3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
SncbQ91ZZ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,54■■■□□ 2,48
SncbQ91ZZ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
SncbQ91ZZ3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
SncbQ91ZZ3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
SncbQ91ZZ3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
SncbQ91ZZ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
SncbQ91ZZ3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
SncbQ91ZZ3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
SncbQ91ZZ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
SncbQ91ZZ3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
SncbQ91ZZ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
SncbQ91ZZ3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
SncbQ91ZZ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
SncbQ91ZZ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
SncbQ91ZZ3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
SncbQ91ZZ3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
SncbQ91ZZ3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
SncbQ91ZZ3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
SncbQ91ZZ3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
SncbQ91ZZ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
SncbQ91ZZ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
SncbQ91ZZ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
SncbQ91ZZ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
SncbQ91ZZ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
SncbQ91ZZ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
SncbQ91ZZ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,66■■■□□ 2,18
SncbQ91ZZ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
SncbQ91ZZ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
SncbQ91ZZ3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
SncbQ91ZZ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
SncbQ91ZZ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
SncbQ91ZZ3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,3■■■□□ 2,12
SncbQ91ZZ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
SncbQ91ZZ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
SncbQ91ZZ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
SncbQ91ZZ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
SncbQ91ZZ3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
SncbQ91ZZ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
SncbQ91ZZ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,17■■■□□ 2,1
SncbQ91ZZ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
SncbQ91ZZ3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
SncbQ91ZZ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
SncbQ91ZZ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
SncbQ91ZZ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
SncbQ91ZZ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
SncbQ91ZZ3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
SncbQ91ZZ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
SncbQ91ZZ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
SncbQ91ZZ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
SncbQ91ZZ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
SncbQ91ZZ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
SncbQ91ZZ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
SncbQ91ZZ3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
SncbQ91ZZ3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
SncbQ91ZZ3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
SncbQ91ZZ3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
SncbQ91ZZ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
SncbQ91ZZ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
SncbQ91ZZ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
SncbQ91ZZ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
SncbQ91ZZ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
SncbQ91ZZ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
SncbQ91ZZ3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
SncbQ91ZZ3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
SncbQ91ZZ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
SncbQ91ZZ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
SncbQ91ZZ3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
SncbQ91ZZ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,45■■□□□ 1,99
SncbQ91ZZ3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
SncbQ91ZZ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
SncbQ91ZZ3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
SncbQ91ZZ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
SncbQ91ZZ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
SncbQ91ZZ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
SncbQ91ZZ3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
SncbQ91ZZ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
SncbQ91ZZ3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,24■■□□□ 1,95
SncbQ91ZZ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
SncbQ91ZZ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
SncbQ91ZZ3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
SncbQ91ZZ3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
SncbQ91ZZ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
SncbQ91ZZ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
SncbQ91ZZ3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
SncbQ91ZZ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
SncbQ91ZZ3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
SncbQ91ZZ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,4 ms