Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SncbQ91ZZ3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SncbQ91ZZ3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SncbQ91ZZ3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SncbQ91ZZ3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SncbQ91ZZ3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SncbQ91ZZ3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SncbQ91ZZ3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SncbQ91ZZ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SncbQ91ZZ3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SncbQ91ZZ3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SncbQ91ZZ3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SncbQ91ZZ3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SncbQ91ZZ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SncbQ91ZZ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SncbQ91ZZ3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SncbQ91ZZ3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SncbQ91ZZ3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SncbQ91ZZ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SncbQ91ZZ3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SncbQ91ZZ3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SncbQ91ZZ3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SncbQ91ZZ3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SncbQ91ZZ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SncbQ91ZZ3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SncbQ91ZZ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SncbQ91ZZ3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SncbQ91ZZ3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SncbQ91ZZ3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SncbQ91ZZ3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SncbQ91ZZ3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SncbQ91ZZ3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SncbQ91ZZ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SncbQ91ZZ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SncbQ91ZZ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SncbQ91ZZ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SncbQ91ZZ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SncbQ91ZZ3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SncbQ91ZZ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SncbQ91ZZ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SncbQ91ZZ3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SncbQ91ZZ3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SncbQ91ZZ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SncbQ91ZZ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SncbQ91ZZ3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SncbQ91ZZ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SncbQ91ZZ3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SncbQ91ZZ3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SncbQ91ZZ3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SncbQ91ZZ3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SncbQ91ZZ3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SncbQ91ZZ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SncbQ91ZZ3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SncbQ91ZZ3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SncbQ91ZZ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SncbQ91ZZ3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SncbQ91ZZ3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SncbQ91ZZ3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SncbQ91ZZ3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SncbQ91ZZ3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SncbQ91ZZ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SncbQ91ZZ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SncbQ91ZZ3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SncbQ91ZZ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SncbQ91ZZ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SncbQ91ZZ3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SncbQ91ZZ3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SncbQ91ZZ3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SncbQ91ZZ3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SncbQ91ZZ3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SncbQ91ZZ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SncbQ91ZZ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SncbQ91ZZ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SncbQ91ZZ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SncbQ91ZZ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SncbQ91ZZ3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SncbQ91ZZ3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SncbQ91ZZ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SncbQ91ZZ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SncbQ91ZZ3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SncbQ91ZZ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SncbQ91ZZ3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SncbQ91ZZ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SncbQ91ZZ3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SncbQ91ZZ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SncbQ91ZZ3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SncbQ91ZZ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SncbQ91ZZ3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SncbQ91ZZ3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SncbQ91ZZ3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SncbQ91ZZ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SncbQ91ZZ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SncbQ91ZZ3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SncbQ91ZZ3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SncbQ91ZZ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SncbQ91ZZ3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SncbQ91ZZ3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SncbQ91ZZ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SncbQ91ZZ3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SncbQ91ZZ3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms