Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2J7

Rell1, RELT-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rell1Q8K2J7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,35■■■■■ 4,05
Rell1Q8K2J7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Rell1Q8K2J7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Rell1Q8K2J7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Rell1Q8K2J7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
Rell1Q8K2J7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,88■■■■□ 3,17
Rell1Q8K2J7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Rell1Q8K2J7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Rell1Q8K2J7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Rell1Q8K2J7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Rell1Q8K2J7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Rell1Q8K2J7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Rell1Q8K2J7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Rell1Q8K2J7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Rell1Q8K2J7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,25■■■□□ 2,91
Rell1Q8K2J7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Rell1Q8K2J7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Rell1Q8K2J7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Rell1Q8K2J7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Rell1Q8K2J7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Rell1Q8K2J7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Rell1Q8K2J7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Rell1Q8K2J7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Rell1Q8K2J7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Rell1Q8K2J7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Rell1Q8K2J7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Rell1Q8K2J7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Rell1Q8K2J7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,98■■■□□ 2,71
Rell1Q8K2J7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Rell1Q8K2J7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Rell1Q8K2J7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Rell1Q8K2J7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
Rell1Q8K2J7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
Rell1Q8K2J7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Rell1Q8K2J7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Rell1Q8K2J7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Rell1Q8K2J7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,52■■■□□ 2,64
Rell1Q8K2J7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Rell1Q8K2J7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Rell1Q8K2J7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Rell1Q8K2J7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Rell1Q8K2J7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Rell1Q8K2J7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Rell1Q8K2J7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Rell1Q8K2J7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Rell1Q8K2J7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Rell1Q8K2J7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Rell1Q8K2J7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Rell1Q8K2J7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Rell1Q8K2J7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Rell1Q8K2J7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Rell1Q8K2J7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rell1Q8K2J7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Rell1Q8K2J7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Rell1Q8K2J7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Rell1Q8K2J7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Rell1Q8K2J7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
Rell1Q8K2J7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rell1Q8K2J7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Rell1Q8K2J7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Rell1Q8K2J7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Rell1Q8K2J7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Rell1Q8K2J7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Rell1Q8K2J7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Rell1Q8K2J7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Rell1Q8K2J7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Rell1Q8K2J7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Rell1Q8K2J7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Rell1Q8K2J7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Rell1Q8K2J7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Rell1Q8K2J7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Rell1Q8K2J7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Rell1Q8K2J7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Rell1Q8K2J7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Rell1Q8K2J7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Rell1Q8K2J7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Rell1Q8K2J7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Rell1Q8K2J7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rell1Q8K2J7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Rell1Q8K2J7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Rell1Q8K2J7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Rell1Q8K2J7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Rell1Q8K2J7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Rell1Q8K2J7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Rell1Q8K2J7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,79■■■□□ 2,36
Rell1Q8K2J7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Rell1Q8K2J7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Rell1Q8K2J7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Rell1Q8K2J7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rell1Q8K2J7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Rell1Q8K2J7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Rell1Q8K2J7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Rell1Q8K2J7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rell1Q8K2J7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Rell1Q8K2J7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Rell1Q8K2J7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Rell1Q8K2J7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rell1Q8K2J7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Rell1Q8K2J7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Rell1Q8K2J7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms